More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5245 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
379 aa  763    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  54.2 
 
 
358 aa  353  4e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  53.62 
 
 
358 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  53.62 
 
 
358 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6040  glycosyl transferase family protein  54.2 
 
 
362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.511032  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1381  glycosyl transferase family protein  54.2 
 
 
362 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6448  glycosyl transferase family protein  54.2 
 
 
362 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776899  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3038  putative heptosyltransferase  53.22 
 
 
371 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1385  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  53.22 
 
 
371 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3167  putative heptosyltransferase  53.22 
 
 
371 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1297  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  52.92 
 
 
371 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161852  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2273  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  52.92 
 
 
371 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0964194  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1009  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  52.63 
 
 
371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  52.94 
 
 
381 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  52.94 
 
 
381 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1986  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  51.96 
 
 
338 aa  311  9e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  48.27 
 
 
390 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  45.86 
 
 
340 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0738  putative LPS biosynthesis related glycosyltransferase  49.03 
 
 
347 aa  259  4e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5041  glycosyl transferase family 9  44.19 
 
 
326 aa  259  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.330457  normal  0.05523 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5589  glycosyl transferase family 9  41.97 
 
 
334 aa  241  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3111  glycosyl transferase family 9  40.58 
 
 
356 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5534  glycosyl transferase family protein  44.48 
 
 
369 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.11539 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1783  glycosyl transferase family protein  40.58 
 
 
335 aa  209  9e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4392  glycosyl transferase family protein  41.83 
 
 
359 aa  190  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.747454  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  35.76 
 
 
352 aa  179  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  38.62 
 
 
362 aa  175  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  34.36 
 
 
368 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3977  glycosyl transferase family protein  35.47 
 
 
376 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67849  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  34.13 
 
 
381 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1781  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
380 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.77 
 
 
368 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0359  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.49 
 
 
348 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.25 
 
 
359 aa  123  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 
382 aa  123  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1752  glycosyl transferase family protein  34 
 
 
317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.57 
 
 
360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5532  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.223974 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  30.77 
 
 
393 aa  117  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.64 
 
 
359 aa  117  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  28.93 
 
 
361 aa  117  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  28.57 
 
 
348 aa  113  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  31.86 
 
 
334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  27.5 
 
 
367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
401 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
401 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1766  glycosyl transferase family protein  33.22 
 
 
318 aa  111  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791628  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
401 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  29.69 
 
 
356 aa  110  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0737  glycosyl transferase ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  36.12 
 
 
370 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.699457  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.29 
 
 
353 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 
400 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  33.02 
 
 
330 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
400 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.69 
 
 
343 aa  106  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 
405 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6399  glycosyl transferase family protein  30.11 
 
 
400 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.0454867 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  23.8 
 
 
330 aa  102  8e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1567  glycosyl transferase family 9  35.03 
 
 
358 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.029243 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.48 
 
 
339 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  24.24 
 
 
779 aa  98.6  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.1 
 
 
382 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
344 aa  97.1  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.92 
 
 
415 aa  96.3  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
364 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.61 
 
 
343 aa  95.1  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1707  glycosyl transferase family 9  29.37 
 
 
322 aa  94.7  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0337  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.61 
 
 
343 aa  94.7  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  25.81 
 
 
354 aa  92.8  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.71 
 
 
389 aa  92.8  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5595  glycosyl transferase family 9  27.76 
 
 
356 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421623  normal  0.389921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2461  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  43.71 
 
 
410 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0320  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  37.84 
 
 
356 aa  92  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  36.1 
 
 
341 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.48 
 
 
352 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3025  heptosyltransferase family protein  26.03 
 
 
517 aa  91.3  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.78 
 
 
343 aa  90.5  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  36.11 
 
 
337 aa  90.5  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  36.1 
 
 
341 aa  90.9  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.98 
 
 
367 aa  90.1  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  35.12 
 
 
346 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 
361 aa  90.1  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 
367 aa  89.7  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0262  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  31.86 
 
 
356 aa  89.7  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0161  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  31.86 
 
 
356 aa  89.7  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00680  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  25.28 
 
 
352 aa  89.4  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0149  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  37.91 
 
 
341 aa  89.4  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001794  ADP-heptose--lipooligosaccharide heptosyltransferase II  25.63 
 
 
352 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.578647  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0341  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.32 
 
 
349 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.455159  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0366  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.6 
 
 
349 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0369  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.32 
 
 
349 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.489126 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4862  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.45 
 
 
349 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0351  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 
328 aa  87.4  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0658  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  35.12 
 
 
346 aa  87  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.73 
 
 
516 aa  87  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  37.32 
 
 
343 aa  86.7  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3108  glycosyl transferase family 9  28.04 
 
 
358 aa  86.3  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0832  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.63 
 
 
346 aa  86.3  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>