More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2231 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  100 
 
 
371 aa  736    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  88.29 
 
 
357 aa  579  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  53.11 
 
 
361 aa  317  3e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  52.31 
 
 
363 aa  293  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  49.21 
 
 
354 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  46.6 
 
 
367 aa  276  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.26 
 
 
339 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 
364 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.32 
 
 
367 aa  105  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  28.3 
 
 
360 aa  105  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.36 
 
 
516 aa  105  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.96 
 
 
362 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1629  heptosyltransferase family protein  28.91 
 
 
341 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.65 
 
 
359 aa  103  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  23.53 
 
 
330 aa  101  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0585  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
406 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0578  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
302 aa  100  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.79 
 
 
348 aa  99  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 
347 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.83 
 
 
343 aa  97.4  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.32 
 
 
332 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.32 
 
 
332 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  29.14 
 
 
389 aa  97.1  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  24.68 
 
 
330 aa  96.7  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  29.12 
 
 
344 aa  96.3  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  25.4 
 
 
406 aa  96.3  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.06 
 
 
343 aa  95.1  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0145  glycosyl transferase family 9  32.21 
 
 
334 aa  94.7  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0787699  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.71 
 
 
332 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0670  ADP-heptoselps heptosyltransferase  29.43 
 
 
365 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.374437  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  28.36 
 
 
344 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1977  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase, putative  29.71 
 
 
365 aa  94.4  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
358 aa  94  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.7 
 
 
359 aa  93.6  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1968  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  29.14 
 
 
388 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.78963  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3715  hypothetical protein  26.83 
 
 
382 aa  93.6  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 
358 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0577  heptosyltransferase family protein  29.14 
 
 
365 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.902815  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  29.24 
 
 
356 aa  93.2  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1756  glycosyl transferase family 9  28.8 
 
 
386 aa  92.8  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0677074  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  30.16 
 
 
352 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  30.03 
 
 
352 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  30.16 
 
 
352 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  30.16 
 
 
352 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0615  glycosyl transferase family 9  34.9 
 
 
388 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 
358 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  30.03 
 
 
352 aa  90.9  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  30.46 
 
 
334 aa  91.3  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.22 
 
 
360 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 
379 aa  90.9  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.74 
 
 
352 aa  90.1  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3628  glycosyl transferase family 9  31.16 
 
 
362 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 
403 aa  89.7  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0907  glycosyl transferase family 9  27.72 
 
 
382 aa  89.7  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II- LPS biosynthesis, waaF  27.99 
 
 
349 aa  89.4  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57864  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3702  glycosyl transferase family 9  31.51 
 
 
408 aa  89.4  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3562  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 
326 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66250  heptosyltransferase II  27.13 
 
 
345 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2230  glycosyl transferase family protein  33.44 
 
 
330 aa  87.8  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0384133  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5747  heptosyltransferase II  26.97 
 
 
345 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.33 
 
 
356 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0682  hypothetical protein  27.76 
 
 
319 aa  87.8  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 
336 aa  87.4  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2415  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 
319 aa  87.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000869235  hitchhiker  0.0000149362 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.33 
 
 
356 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.33 
 
 
356 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.33 
 
 
356 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.33 
 
 
356 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0334  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.93 
 
 
343 aa  86.7  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0009  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.28 
 
 
349 aa  86.3  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.83 
 
 
341 aa  85.9  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.84327 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  28.39 
 
 
356 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  29.79 
 
 
340 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1535  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.94 
 
 
346 aa  85.5  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  29.79 
 
 
340 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0610  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 
321 aa  85.5  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  29.79 
 
 
340 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  28.82 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2581  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.82 
 
 
332 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0315509  normal  0.0579279 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  33.97 
 
 
362 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.08 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0341  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.72 
 
 
349 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.455159  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.48 
 
 
353 aa  84  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0366  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.44 
 
 
349 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0369  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.72 
 
 
349 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.489126 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3478  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.76 
 
 
334 aa  84  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  23.41 
 
 
367 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  29.06 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  25.5 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.63 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.08 
 
 
361 aa  83.2  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  27.54 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.25 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.24 
 
 
356 aa  82.8  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4862  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.22 
 
 
349 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  26.95 
 
 
402 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.14 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2661  glycosyl transferase family 9  24.92 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141025 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0371  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 
378 aa  82.8  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  28.53 
 
 
390 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>