More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0157 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
382 aa  777    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  38.2 
 
 
369 aa  223  6e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3149  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 
400 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4830  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 
363 aa  127  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.244067  hitchhiker  0.0000484932 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  30.66 
 
 
356 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.7 
 
 
348 aa  123  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.82 
 
 
359 aa  123  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 
379 aa  123  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  28.53 
 
 
360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.61 
 
 
359 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  31.4 
 
 
779 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.46 
 
 
343 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  27.86 
 
 
361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 
400 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.51 
 
 
339 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  30.11 
 
 
350 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 
401 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 
401 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  28.61 
 
 
358 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 
401 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1385  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.77 
 
 
371 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 
358 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3038  putative heptosyltransferase  29.77 
 
 
371 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.8 
 
 
361 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3167  putative heptosyltransferase  29.77 
 
 
371 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
347 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2273  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.52 
 
 
371 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0964194  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1297  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.52 
 
 
371 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161852  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 
405 aa  103  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  28.73 
 
 
358 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.12 
 
 
360 aa  100  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.79 
 
 
368 aa  100  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.65 
 
 
361 aa  99.8  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1009  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.26 
 
 
371 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.14 
 
 
343 aa  98.2  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.12 
 
 
352 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
364 aa  97.4  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.45 
 
 
415 aa  97.1  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  30.09 
 
 
334 aa  96.3  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 
379 aa  96.3  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4883  glycosyl transferase family 9  27.82 
 
 
403 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  0.0526108 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1567  glycosyl transferase family 9  34.52 
 
 
358 aa  95.5  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.029243 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3806  glycosyl transferase family 9  27.82 
 
 
403 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  25.83 
 
 
348 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  26.48 
 
 
354 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0851  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.39 
 
 
346 aa  95.1  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1791  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 
408 aa  94.4  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306314  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.96 
 
 
516 aa  94.7  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 
344 aa  94  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1535  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.93 
 
 
346 aa  93.6  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  30.23 
 
 
337 aa  93.6  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1986  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.01 
 
 
338 aa  93.2  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  29.12 
 
 
367 aa  92.8  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25 
 
 
382 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  23.94 
 
 
409 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  29.46 
 
 
381 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6040  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
362 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.511032  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.27 
 
 
352 aa  89.7  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5595  glycosyl transferase family 9  25.07 
 
 
356 aa  89.4  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421623  normal  0.389921 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5042  glycosyl transferase family 9  27.51 
 
 
372 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502044  normal  0.0534111 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6399  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 
400 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.0454867 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.57 
 
 
393 aa  89.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1381  glycosyl transferase family protein  27.55 
 
 
362 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6448  glycosyl transferase family protein  27.55 
 
 
362 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776899  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  26.87 
 
 
367 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  25.84 
 
 
341 aa  87  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  27.76 
 
 
352 aa  86.7  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  29.3 
 
 
381 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  29.3 
 
 
381 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  26.61 
 
 
351 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0111  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 
359 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0149  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.91 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  26.61 
 
 
351 aa  84.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.34 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0205  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.58 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.34 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2239  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
431 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 
361 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0454  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.84 
 
 
341 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  0.709845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  29.45 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1752  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
317 aa  82.8  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
348 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  30.03 
 
 
340 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.96 
 
 
353 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.28 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.83 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1571  glycosyl transferase family 9  28.12 
 
 
338 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3108  glycosyl transferase family 9  27.01 
 
 
358 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2331  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.11 
 
 
366 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000713254  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.49 
 
 
332 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0229  glycosyl transferase family 9  26.23 
 
 
348 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3025  heptosyltransferase family protein  25.4 
 
 
517 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4100  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 
368 aa  80.5  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  25.08 
 
 
348 aa  80.5  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1745  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 
406 aa  80.1  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>