More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1514 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  100 
 
 
363 aa  724    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  58.4 
 
 
354 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  58.38 
 
 
367 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  61.28 
 
 
361 aa  391  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  50.14 
 
 
357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  52.31 
 
 
371 aa  324  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  33.14 
 
 
364 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  33.11 
 
 
403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 
406 aa  125  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.14 
 
 
362 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.37 
 
 
360 aa  123  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.06 
 
 
359 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.95 
 
 
516 aa  119  6e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.94 
 
 
343 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  28.49 
 
 
379 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.57 
 
 
339 aa  116  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.74 
 
 
352 aa  116  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1756  glycosyl transferase family 9  31.29 
 
 
386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0677074  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  27.27 
 
 
330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.05 
 
 
332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.05 
 
 
332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.45 
 
 
359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.47 
 
 
348 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1968  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  26.36 
 
 
388 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.78963  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0578  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 
302 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1977  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase, putative  27.92 
 
 
365 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.92 
 
 
368 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0670  ADP-heptoselps heptosyltransferase  26.82 
 
 
365 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.374437  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3715  hypothetical protein  27.44 
 
 
382 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.9 
 
 
367 aa  106  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
347 aa  106  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.86 
 
 
332 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0577  heptosyltransferase family protein  26.54 
 
 
365 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.902815  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
344 aa  105  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  27.64 
 
 
367 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2239  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 
431 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  29.48 
 
 
344 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1297  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.53 
 
 
357 aa  103  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  27.3 
 
 
348 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  33.14 
 
 
337 aa  103  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  25.39 
 
 
330 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.73 
 
 
389 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  27.06 
 
 
356 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2822  glycosyl transferase family 9  27.22 
 
 
357 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  36.73 
 
 
362 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0585  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
406 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  28.57 
 
 
351 aa  99.8  7e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  26.32 
 
 
779 aa  99.4  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0907  glycosyl transferase family 9  26.17 
 
 
382 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  26.41 
 
 
344 aa  99  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  28.57 
 
 
351 aa  99.4  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  28.61 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.41 
 
 
367 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1069  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.12 
 
 
356 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  26.09 
 
 
360 aa  98.6  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5670  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.81 
 
 
354 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  25.86 
 
 
329 aa  97.1  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  25.74 
 
 
373 aa  97.1  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3035  glycosyl transferase family 9  28.12 
 
 
341 aa  97.1  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.128179 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3628  glycosyl transferase family 9  30 
 
 
362 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 
358 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3025  heptosyltransferase family protein  30.03 
 
 
517 aa  96.7  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  25.74 
 
 
356 aa  96.7  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
379 aa  96.7  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1601  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.9 
 
 
358 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 
401 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1629  heptosyltransferase family protein  35.5 
 
 
341 aa  96.3  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
405 aa  96.3  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
344 aa  95.9  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.63 
 
 
343 aa  95.5  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  30.14 
 
 
334 aa  95.5  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.01 
 
 
360 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1986  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  37.5 
 
 
338 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2273  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  37.5 
 
 
371 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0964194  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3038  putative heptosyltransferase  37.34 
 
 
371 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1385  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  37.34 
 
 
371 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4509  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.57 
 
 
358 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.984943  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1297  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  37.5 
 
 
371 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161852  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3167  putative heptosyltransferase  37.34 
 
 
371 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
358 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  28.61 
 
 
401 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  28.61 
 
 
401 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3702  glycosyl transferase family 9  29.67 
 
 
408 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3562  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 
326 aa  93.2  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 
400 aa  93.2  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.61 
 
 
361 aa  92.8  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  22.99 
 
 
354 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  33.33 
 
 
381 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  33.33 
 
 
381 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  24.65 
 
 
409 aa  92  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  24.51 
 
 
336 aa  92.4  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0977  glycosyl transferase family 9  32.33 
 
 
336 aa  92.4  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.412214  hitchhiker  0.000380468 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0738  putative LPS biosynthesis related glycosyltransferase  30.46 
 
 
347 aa  91.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  26.1 
 
 
332 aa  91.3  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4092  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.47 
 
 
340 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102262  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  30.31 
 
 
330 aa  91.3  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2581  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.41 
 
 
332 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0315509  normal  0.0579279 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1613  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.92 
 
 
358 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.938574  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 
369 aa  90.5  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>