More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5648 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  97.21 
 
 		 358 aa  686    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 358 aa  721    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1381  glycosyl transferase family protein  89.3 
 
 		 362 aa  621  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6448  glycosyl transferase family protein  89.3 
 
 		 362 aa  621  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6040  glycosyl transferase family protein  89.01 
 
 		 362 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.511032  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  83.52 
 
 		 358 aa  610  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3167  putative heptosyltransferase  70.49 
 
 		 371 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1385  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  70.49 
 
 		 371 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3038  putative heptosyltransferase  70.49 
 
 		 371 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1297  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  70.2 
 
 		 371 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161852  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2273  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  70.2 
 
 		 371 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0964194  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1009  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  69.91 
 
 		 371 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1986  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  69.23 
 
 		 338 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  58.79 
 
 		 390 aa  355  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  53.62 
 
 		 379 aa  347  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  51.64 
 
 		 381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  51.64 
 
 		 381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5041  glycosyl transferase family 9  45.85 
 
 		 326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.330457  normal  0.05523 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  46.25 
 
 		 340 aa  251  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3111  glycosyl transferase family 9  44.13 
 
 		 356 aa  242  7e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5589  glycosyl transferase family 9  45.7 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0738  putative LPS biosynthesis related glycosyltransferase  47.04 
 
 		 347 aa  241  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4392  glycosyl transferase family protein  45.87 
 
 		 359 aa  219  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.747454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5534  glycosyl transferase family protein  45.65 
 
 		 369 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.11539 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  40.39 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1783  glycosyl transferase family protein  39.62 
 
 		 335 aa  208  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  36.89 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  33.89 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3977  glycosyl transferase family protein  33.52 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1781  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 		 380 aa  134  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.11 
 
 		 360 aa  132  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  31.37 
 
 		 381 aa  132  7.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 		 379 aa  126  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1752  glycosyl transferase family protein  31.95 
 
 		 317 aa  125  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.07 
 
 		 348 aa  123  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  33.14 
 
 		 334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0359  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0737  glycosyl transferase ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  33.99 
 
 		 370 aa  116  7.999999999999999e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.699457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1766  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.83 
 
 		 343 aa  113  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.69 
 
 		 368 aa  113  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1567  glycosyl transferase family 9  33.77 
 
 		 358 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.029243 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.17 
 
 		 359 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5532  glycosyl transferase family protein  33.14 
 
 		 359 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223974 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  43.75 
 
 		 405 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  31 
 
 		 401 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  31 
 
 		 401 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  24.57 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.09 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  29.76 
 
 		 348 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  34.81 
 
 		 330 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  27.59 
 
 		 361 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  31.16 
 
 		 393 aa  103  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  30.09 
 
 		 356 aa  102  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  27.22 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  32.12 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 		 401 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  27.3 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.84 
 
 		 359 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 		 364 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11210  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  31.07 
 
 		 358 aa  97.4  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.957009  normal  0.0981692 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  27.12 
 
 		 360 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.06 
 
 		 415 aa  94.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 		 369 aa  94.4  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  29.97 
 
 		 371 aa  93.6  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  27.14 
 
 		 367 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0320  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  37.97 
 
 		 356 aa  93.2  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0462  glycosyl transferase family 9  33.11 
 
 		 311 aa  92.8  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  34.78 
 
 		 367 aa  92.8  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6399  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 		 400 aa  92.8  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.0454867 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1900  glycosyl transferase family 9  30.5 
 
 		 324 aa  92.8  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0710  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 		 339 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0566635  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0351  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 		 328 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3562  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 		 326 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0353  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 		 357 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 		 403 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2461  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  50 
 
 		 410 aa  90.1  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.13 
 
 		 352 aa  90.1  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  26.95 
 
 		 361 aa  90.1  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 		 357 aa  90.1  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  24.87 
 
 		 354 aa  89.7  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  37.42 
 
 		 337 aa  89.4  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  36.31 
 
 		 343 aa  89.4  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0149  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.16 
 
 		 341 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  28.57 
 
 		 357 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.87 
 
 		 361 aa  87  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3628  glycosyl transferase family 9  32.09 
 
 		 362 aa  86.3  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0457  glycosyl transferase family 9  30.79 
 
 		 341 aa  86.3  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.68138  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3702  glycosyl transferase family 9  32.09 
 
 		 408 aa  86.3  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  39.61 
 
 		 363 aa  86.3  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  30.52 
 
 		 361 aa  86.3  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5206  glycosyl transferase family 9  35.61 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0690  glycosyl transferase family 9  41.45 
 
 		 511 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.379313  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  28.25 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  27.97 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  32.25 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0312  glycosyl transferase family 9  37.27 
 
 		 574 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>