More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6396 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 358 aa  719    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  97.21 
 
 		 358 aa  686    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  84.64 
 
 		 358 aa  615  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6040  glycosyl transferase family protein  88.52 
 
 		 362 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.511032  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1381  glycosyl transferase family protein  89.01 
 
 		 362 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6448  glycosyl transferase family protein  89.01 
 
 		 362 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3167  putative heptosyltransferase  71.63 
 
 		 371 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1385  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  71.63 
 
 		 371 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3038  putative heptosyltransferase  71.63 
 
 		 371 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2273  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  71.35 
 
 		 371 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0964194  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1297  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  71.35 
 
 		 371 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161852  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1009  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  71.06 
 
 		 371 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1986  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  70.41 
 
 		 338 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  58.79 
 
 		 390 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  53.62 
 
 		 379 aa  347  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  51.88 
 
 		 381 aa  309  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  51.88 
 
 		 381 aa  309  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  45.43 
 
 		 340 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5041  glycosyl transferase family 9  45.36 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.330457  normal  0.05523 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0738  putative LPS biosynthesis related glycosyltransferase  47.35 
 
 		 347 aa  241  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3111  glycosyl transferase family 9  43.4 
 
 		 356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5589  glycosyl transferase family 9  44.41 
 
 		 334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4392  glycosyl transferase family protein  46.2 
 
 		 359 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.747454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5534  glycosyl transferase family protein  46.62 
 
 		 369 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.11539 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  39.94 
 
 		 352 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1783  glycosyl transferase family protein  39.5 
 
 		 335 aa  206  7e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  37.18 
 
 		 362 aa  168  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  36.25 
 
 		 368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3977  glycosyl transferase family protein  34.82 
 
 		 376 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  33.33 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1781  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 		 380 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.02 
 
 		 360 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1752  glycosyl transferase family protein  32.83 
 
 		 317 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0359  glycosyl transferase family protein  32.55 
 
 		 402 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0737  glycosyl transferase ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  35.11 
 
 		 370 aa  122  7e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.699457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.7 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  33.43 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.17 
 
 		 368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1567  glycosyl transferase family 9  34.63 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.029243 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1766  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 		 318 aa  113  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5532  glycosyl transferase family protein  33.71 
 
 		 359 aa  112  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223974 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 		 400 aa  112  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.55 
 
 		 343 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.03 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  43.75 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  34.81 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  31.44 
 
 		 393 aa  103  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  29.59 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.4 
 
 		 359 aa  103  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  27.22 
 
 		 361 aa  102  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  23.7 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.12 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  30.77 
 
 		 356 aa  99.8  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  26.67 
 
 		 349 aa  97.8  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11210  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  31.07 
 
 		 358 aa  97.4  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.957009  normal  0.0981692 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 		 364 aa  96.3  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  26.74 
 
 		 349 aa  96.7  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.36 
 
 		 415 aa  96.3  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  30.27 
 
 		 371 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0320  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  38.61 
 
 		 356 aa  94.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 		 369 aa  94.4  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  27.25 
 
 		 367 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0710  glycosyl transferase family protein  33.63 
 
 		 339 aa  92.8  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0566635  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  27.12 
 
 		 360 aa  92.8  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6399  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 		 400 aa  92.8  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.0454867 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0462  glycosyl transferase family 9  32.95 
 
 		 311 aa  92.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1900  glycosyl transferase family 9  30.41 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.41 
 
 		 352 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  35.4 
 
 		 367 aa  90.9  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0351  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 		 328 aa  90.5  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  38.06 
 
 		 337 aa  90.1  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  26.95 
 
 		 361 aa  90.1  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  28.87 
 
 		 357 aa  89.7  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2461  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  50 
 
 		 410 aa  89.4  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 		 403 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3562  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 		 326 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0149  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  36.6 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0353  glycosyl transferase family protein  29.16 
 
 		 357 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  35.67 
 
 		 343 aa  87.8  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  30.67 
 
 		 361 aa  87.4  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.16 
 
 		 361 aa  87.4  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  24.6 
 
 		 354 aa  87  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5206  glycosyl transferase family 9  36.36 
 
 		 401 aa  86.3  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.62 
 
 		 357 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0690  glycosyl transferase family 9  41.45 
 
 		 511 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.379313  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0457  glycosyl transferase family 9  30.79 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.68138  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  39.26 
 
 		 363 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3628  glycosyl transferase family 9  32.13 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3702  glycosyl transferase family 9  32.09 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3170  heptosyltransferase family protein  39.31 
 
 		 622 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3108  glycosyl transferase family 9  31.89 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2276  heptosyltransferase family protein  39.31 
 
 		 622 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  27.02 
 
 		 779 aa  82.8  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>