More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1384 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6399  glycosyl transferase family protein  87.53 
 
 
400 aa  660    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.0454867 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
401 aa  798    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  86.78 
 
 
400 aa  683    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
401 aa  798    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  97.26 
 
 
401 aa  746    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  81.55 
 
 
405 aa  628  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  59.13 
 
 
415 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  56.42 
 
 
400 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  53.59 
 
 
393 aa  332  6e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  48.8 
 
 
382 aa  319  5e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4883  glycosyl transferase family 9  51.36 
 
 
403 aa  309  6.999999999999999e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  0.0526108 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3806  glycosyl transferase family 9  51.36 
 
 
403 aa  309  6.999999999999999e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1791  glycosyl transferase family protein  45.78 
 
 
408 aa  282  7.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306314  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3108  glycosyl transferase family 9  48.21 
 
 
358 aa  276  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1989  heptosyltransferase family protein  74.57 
 
 
625 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1388  heptosyltransferase family protein  75.14 
 
 
643 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3041  heptosyltransferase family protein  75.14 
 
 
622 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1300  heptosyltransferase family protein  74.57 
 
 
625 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1012  heptosyltransferase family protein  74.57 
 
 
628 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3170  heptosyltransferase family protein  75.14 
 
 
622 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2276  heptosyltransferase family protein  74.57 
 
 
622 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5042  glycosyl transferase family 9  42.25 
 
 
372 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502044  normal  0.0534111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5595  glycosyl transferase family 9  42.86 
 
 
356 aa  236  6e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421623  normal  0.389921 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  40.16 
 
 
361 aa  233  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  34.49 
 
 
348 aa  194  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  35.15 
 
 
367 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  37.53 
 
 
344 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1571  glycosyl transferase family 9  37.85 
 
 
338 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0457  glycosyl transferase family 9  39.39 
 
 
341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.68138  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  37.85 
 
 
343 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0353  glycosyl transferase family protein  34.39 
 
 
357 aa  139  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0567  glycosyl transferase family 9  32.15 
 
 
362 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1760  HAD superfamily hydrolase  35.47 
 
 
593 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1746  HAD superfamily hydrolase  35.96 
 
 
593 aa  125  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0409111 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.81 
 
 
359 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  31.65 
 
 
356 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.83 
 
 
352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.64 
 
 
359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0897  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  34.14 
 
 
467 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29463  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.59 
 
 
348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  32.7 
 
 
390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  28.11 
 
 
361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
379 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.77 
 
 
343 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11250  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  34.79 
 
 
360 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.706344  normal  0.204518 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 
382 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.08 
 
 
346 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.46 
 
 
360 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.84 
 
 
368 aa  106  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
364 aa  106  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.28 
 
 
341 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0454  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.94 
 
 
341 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  0.709845 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  27.22 
 
 
369 aa  103  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.1 
 
 
362 aa  103  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 
358 aa  103  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
358 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  30.73 
 
 
341 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  29.53 
 
 
341 aa  101  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3111  glycosyl transferase family 9  28.66 
 
 
356 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  30.62 
 
 
358 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.6 
 
 
352 aa  100  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2459  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase, glycosyl transferase, family 9  31.45 
 
 
398 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262404  normal  0.245391 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.02 
 
 
341 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  26.24 
 
 
779 aa  98.6  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.02 
 
 
341 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  30.38 
 
 
352 aa  97.8  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0990  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.54 
 
 
346 aa  96.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0832  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.54 
 
 
346 aa  96.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0291  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.27 
 
 
346 aa  96.7  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0586  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.27 
 
 
346 aa  96.7  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2419  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.27 
 
 
346 aa  96.7  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  22.41 
 
 
330 aa  96.7  7e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0032  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.27 
 
 
376 aa  96.3  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.3 
 
 
339 aa  95.9  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.54 
 
 
367 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.82 
 
 
353 aa  95.5  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0658  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.27 
 
 
346 aa  95.5  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.1 
 
 
516 aa  94.7  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2553  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.25 
 
 
345 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.61 
 
 
361 aa  94.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  26.43 
 
 
354 aa  94.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.48 
 
 
367 aa  94  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0665  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.25 
 
 
345 aa  94.4  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1707  glycosyl transferase family 9  28.45 
 
 
322 aa  92.8  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2022  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.53 
 
 
345 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2633  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.53 
 
 
345 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609317  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  28.49 
 
 
361 aa  90.9  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  25.14 
 
 
347 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4862  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.39 
 
 
349 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28 
 
 
343 aa  90.5  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0366  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.94 
 
 
349 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  33.82 
 
 
362 aa  89.7  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  23.4 
 
 
360 aa  89.4  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.07 
 
 
343 aa  89.4  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0337  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.92 
 
 
343 aa  89.4  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  26.58 
 
 
351 aa  89  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0369  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.67 
 
 
349 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.489126 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  26.58 
 
 
351 aa  88.6  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0341  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.67 
 
 
349 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.455159  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3167  putative heptosyltransferase  31.4 
 
 
371 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>