More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0585 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0585  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 406 aa  819    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  56.65 
 
 		 406 aa  464  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0548  glycosyl transferase family 9  26.32 
 
 		 419 aa  144  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0259889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1411  glycosyl transferase family protein  26.59 
 
 		 419 aa  137  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  28.54 
 
 		 367 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1745  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 		 406 aa  126  6e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  26.61 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  30.98 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.26 
 
 		 359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  28.42 
 
 		 357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.33 
 
 		 368 aa  116  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  29.6 
 
 		 352 aa  116  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  29.11 
 
 		 371 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.65 
 
 		 359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  27.54 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.18 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0465  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 		 415 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.19634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.89 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.58 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1574  glycosyl transferase family 9  27.37 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1756  glycosyl transferase family 9  27.59 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0677074  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.67 
 
 		 360 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.17 
 
 		 352 aa  106  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.15 
 
 		 362 aa  102  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0319  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0489134 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 		 379 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  29.38 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.84 
 
 		 361 aa  100  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2239  glycosyl transferase family protein  25.69 
 
 		 431 aa  99.4  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  28.57 
 
 		 356 aa  97.1  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0670  ADP-heptoselps heptosyltransferase  27.18 
 
 		 365 aa  96.3  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.374437  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1977  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase, putative  28.15 
 
 		 365 aa  96.3  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1968  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  26.54 
 
 		 388 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.78963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0577  heptosyltransferase family protein  26.54 
 
 		 365 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.902815  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3715  hypothetical protein  25.07 
 
 		 382 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2331  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.35 
 
 		 366 aa  91.3  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000713254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0626  glycosyl transferase family protein  26.59 
 
 		 340 aa  91.3  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0429094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  26.18 
 
 		 779 aa  90.5  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5589  glycosyl transferase family 9  26.32 
 
 		 334 aa  89.7  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3025  heptosyltransferase family protein  27.53 
 
 		 517 aa  89.4  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  23.88 
 
 		 330 aa  89.7  9e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0907  glycosyl transferase family 9  25.91 
 
 		 382 aa  89.4  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 369 aa  89.7  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2242  heptosyltransferase family protein  27.79 
 
 		 355 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 		 347 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  28.57 
 
 		 352 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.4 
 
 		 339 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1870  heptosyltransferase family protein  27.25 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  21.63 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.73 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  28.3 
 
 		 323 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.18 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.78 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.77 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.77 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4862  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.58 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.69 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  26.61 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.77 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.77 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  25.5 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  25.8 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1100  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  22.53 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000330109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.54 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.26 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0473  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.29 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.189899  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2022  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.55 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2633  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.55 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609317  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2553  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.55 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.93 
 
 		 356 aa  79.7  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.59 
 
 		 367 aa  79.3  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0665  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.55 
 
 		 345 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5534  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 369 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.11539 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  26.21 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  35.5 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  27.61 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.13 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.89 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  22.67 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  21.33 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0520  glycosyl transferase family protein  24.72 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2461  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  43.97 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.3 
 
 		 516 aa  77.4  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  25.85 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.71 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0366  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.79 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.71 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3934  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157476  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0341  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.95 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.455159  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0851  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.39 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0465  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.43 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0369  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.79 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.489126 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.12 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II- LPS biosynthesis, waaF  27.99 
 
 		 349 aa  75.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57864  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0393  glycosyl transferase family protein  21.88 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.326109  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3771  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.69 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.554528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>