299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0319 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0319  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
413 aa  837    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0489134 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0465  glycosyl transferase family protein  84.8 
 
 
415 aa  689    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.19634  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1745  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 
406 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0548  glycosyl transferase family 9  34.2 
 
 
419 aa  208  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0259889  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1411  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
419 aa  205  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 
406 aa  117  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0585  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
406 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2239  glycosyl transferase family protein  26.68 
 
 
431 aa  94.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  25.2 
 
 
360 aa  92  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1756  glycosyl transferase family 9  28.45 
 
 
386 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0677074  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1574  glycosyl transferase family 9  24.41 
 
 
379 aa  87  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  26.49 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  24.4 
 
 
367 aa  84  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0337  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.59 
 
 
343 aa  82.8  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.76 
 
 
343 aa  82.4  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.68 
 
 
343 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 
364 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.12 
 
 
343 aa  81.6  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.49 
 
 
516 aa  78.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0341  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.83 
 
 
349 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.455159  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0366  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.12 
 
 
349 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  24.81 
 
 
357 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.15 
 
 
360 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0369  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.83 
 
 
349 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.489126 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4862  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.56 
 
 
349 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.13 
 
 
368 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0465  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.27 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.61 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.57 
 
 
392 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.73 
 
 
353 aa  73.9  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
404 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1535  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.46 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0009  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25 
 
 
349 aa  72.8  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.82 
 
 
361 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  26.47 
 
 
381 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0320  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.45 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  24.51 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
475 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  24.44 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0161  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  23.01 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2616  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  22.13 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0262  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  23.01 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.03 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0789  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.7 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 
392 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 
392 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  28.73 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5003  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.4 
 
 
344 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.96 
 
 
360 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.81 
 
 
367 aa  69.3  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1977  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase, putative  26.59 
 
 
365 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  23.77 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3770  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.49 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.242011  normal  0.536434 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II- LPS biosynthesis, waaF  25.96 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57864  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1069  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.95 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1968  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  26.27 
 
 
388 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.78963  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0579  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.77 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0417722 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0577  heptosyltransferase family protein  26.39 
 
 
365 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.902815  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0670  ADP-heptoselps heptosyltransferase  26.87 
 
 
365 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.374437  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2792  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.79 
 
 
362 aa  67.4  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0445733  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0520  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 
344 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.07 
 
 
346 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  22.45 
 
 
409 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.48 
 
 
361 aa  65.1  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  24.64 
 
 
379 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  34.57 
 
 
362 aa  63.9  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.22 
 
 
390 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  23.22 
 
 
344 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  25.22 
 
 
394 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1297  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.46 
 
 
357 aa  63.9  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5670  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.89 
 
 
354 aa  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  25.22 
 
 
390 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  25.22 
 
 
390 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  25.22 
 
 
390 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  25.22 
 
 
390 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.22 
 
 
390 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0907  glycosyl transferase family 9  24.04 
 
 
382 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.07 
 
 
341 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0491  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.93 
 
 
354 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1612  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  22.93 
 
 
346 aa  62.8  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0832  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.8 
 
 
346 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0172  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  24.65 
 
 
350 aa  61.6  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.063279  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0545  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.54 
 
 
340 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0086605  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  20.82 
 
 
330 aa  62  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0990  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.8 
 
 
346 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0658  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.86 
 
 
346 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  26.11 
 
 
458 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  24.21 
 
 
350 aa  61.6  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  25.74 
 
 
341 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  24.01 
 
 
348 aa  60.8  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66250  heptosyltransferase II  24.19 
 
 
345 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.05 
 
 
341 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3715  hypothetical protein  22.73 
 
 
382 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0334  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.2 
 
 
343 aa  60.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0586  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.98 
 
 
346 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  21.93 
 
 
348 aa  60.1  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0291  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.98 
 
 
346 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  22.29 
 
 
373 aa  60.1  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2419  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.98 
 
 
346 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>