More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1203 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  99.23 
 
 
390 aa  773    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  98.97 
 
 
394 aa  771    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  99.23 
 
 
390 aa  773    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  89.51 
 
 
458 aa  694    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  99.49 
 
 
390 aa  776    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  100 
 
 
390 aa  784    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  99.23 
 
 
390 aa  773    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  99.23 
 
 
390 aa  773    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  67.36 
 
 
404 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  67.36 
 
 
392 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  67.62 
 
 
392 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  67.62 
 
 
392 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  66.06 
 
 
402 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  66.32 
 
 
475 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  62.06 
 
 
392 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1248  glycosyl transferase family 9  34.84 
 
 
385 aa  214  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.9727 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0607  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 
386 aa  209  5e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2341  glycosyl transferase family protein  36.21 
 
 
390 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0778  glycosyl transferase family 9  33.6 
 
 
369 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2252  heptosyltransferase family protein  33.6 
 
 
370 aa  158  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.548459  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  35.58 
 
 
350 aa  149  7e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1231  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  29.95 
 
 
356 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.63 
 
 
367 aa  135  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  30.03 
 
 
360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  29.08 
 
 
361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  29.44 
 
 
352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3516  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  32.79 
 
 
387 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0852  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  32.46 
 
 
387 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3647  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  32.46 
 
 
397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.74 
 
 
356 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.74 
 
 
356 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.74 
 
 
356 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.74 
 
 
356 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.74 
 
 
356 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0473  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.33 
 
 
356 aa  124  4e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.189899  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  28.2 
 
 
361 aa  124  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  28.05 
 
 
330 aa  123  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1403  putative heptosyltransferase III waaq  29.11 
 
 
356 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.308915  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.27 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.27 
 
 
352 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.27 
 
 
352 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.27 
 
 
352 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.8 
 
 
356 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  32.14 
 
 
361 aa  119  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1800  LPS heptosyltransferase-like  28.12 
 
 
362 aa  119  9e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597786 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.44 
 
 
356 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.7 
 
 
352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  30.07 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0391  glycosyl transferase family 9  26.8 
 
 
359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0900723  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.17 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.17 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  28.17 
 
 
340 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  29.9 
 
 
360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.06 
 
 
367 aa  106  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.48 
 
 
357 aa  102  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  26.58 
 
 
779 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.59 
 
 
360 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00662  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase III  25.65 
 
 
351 aa  100  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  26.57 
 
 
334 aa  99.8  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  25.08 
 
 
409 aa  99.8  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 
364 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001811  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.62 
 
 
340 aa  99.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.95 
 
 
339 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1756  glycosyl transferase family 9  27.6 
 
 
386 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0677074  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.54 
 
 
343 aa  90.5  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.3 
 
 
368 aa  90.1  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  25.41 
 
 
349 aa  89.7  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  25.08 
 
 
349 aa  89.7  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
379 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2725  glycosyl transferase family protein  28.66 
 
 
346 aa  87.8  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.756386  normal  0.0898734 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  22.4 
 
 
373 aa  87.8  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  22.4 
 
 
356 aa  87.8  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  24.41 
 
 
347 aa  87.8  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2260  glycosyl transferase family protein  25.72 
 
 
364 aa  87  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  21.17 
 
 
348 aa  87  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  39.82 
 
 
334 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  26 
 
 
361 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0307  glycosyl transferase family 9  24.83 
 
 
374 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 
350 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  24.04 
 
 
354 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02452  heptosyl transferase, glycosyltransferase family 9 protein  27.93 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1824  glycosyl transferase family 9  32.47 
 
 
390 aa  84  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5746  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.13 
 
 
355 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887327  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  24.59 
 
 
406 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  29.22 
 
 
349 aa  82.4  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 
347 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.14 
 
 
516 aa  82.8  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  26.74 
 
 
344 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1574  glycosyl transferase family 9  29.45 
 
 
379 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66240  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.08 
 
 
354 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0615  glycosyl transferase family 9  28.81 
 
 
388 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5670  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.22 
 
 
354 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.73 
 
 
348 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  24.72 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  24.87 
 
 
347 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  25.08 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4336  glycosyl transferase family protein  24.75 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.2 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2331  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.86 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000713254  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3479  glycosyl transferase family 9  26.26 
 
 
342 aa  80.5  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>