More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2514 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
333 aa  688    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  66.87 
 
 
332 aa  474  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0145  glycosyl transferase family 9  63.17 
 
 
334 aa  436  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0787699  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  59.76 
 
 
334 aa  412  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  57.7 
 
 
335 aa  392  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0160  glycosyl transferase family 9  53.94 
 
 
345 aa  371  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.081148  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0093  heptosyltransferase  57.14 
 
 
335 aa  373  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.283951  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2622  glycosyl transferase family 9  38.04 
 
 
327 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  37.46 
 
 
329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2827  glycosyl transferase family 9  33.03 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 
324 aa  183  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  26.32 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  28.91 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  25.67 
 
 
330 aa  130  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.6 
 
 
516 aa  125  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.35 
 
 
348 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.42 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.42 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.11 
 
 
332 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3479  glycosyl transferase family 9  28.53 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  35.03 
 
 
344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1683  heptosyltransferase family protein  27.88 
 
 
339 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943397  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2822  glycosyl transferase family 9  26.02 
 
 
357 aa  105  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00680  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  27.64 
 
 
352 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
344 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2616  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.94 
 
 
346 aa  103  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  29.55 
 
 
360 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1722  glycosyl transferase family 9  25.29 
 
 
350 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0229  glycosyl transferase family 9  25.36 
 
 
348 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3077  glycosyl transferase family 9  26.2 
 
 
355 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212218 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1515  glycosyl transferase family 9  25 
 
 
315 aa  100  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II- LPS biosynthesis, waaF  29.19 
 
 
349 aa  99  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.3 
 
 
339 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5003  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.86 
 
 
344 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0454  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.45 
 
 
341 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  0.709845 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2022  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.79 
 
 
345 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2633  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.79 
 
 
345 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609317  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.92 
 
 
341 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001794  ADP-heptose--lipooligosaccharide heptosyltransferase II  26.78 
 
 
352 aa  96.3  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.578647  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.89 
 
 
346 aa  96.3  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  26.48 
 
 
341 aa  95.9  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0520  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
344 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0665  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.2 
 
 
345 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4862  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.35 
 
 
349 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2553  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.92 
 
 
345 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0579  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.2 
 
 
347 aa  94  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0417722 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.2 
 
 
341 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.91 
 
 
341 aa  92.8  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0369  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.65 
 
 
349 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.489126 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0172  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  26.84 
 
 
350 aa  92.8  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.063279  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0768  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.8 
 
 
346 aa  92.4  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  27.79 
 
 
341 aa  92.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0658  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.89 
 
 
346 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0491  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.2 
 
 
354 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1612  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.41 
 
 
346 aa  92  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0607  glycosyl transferase family protein  23.62 
 
 
386 aa  91.7  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0262  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  27.07 
 
 
356 aa  91.3  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5747  heptosyltransferase II  27.79 
 
 
345 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0161  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  27.07 
 
 
356 aa  91.3  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0341  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.36 
 
 
349 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.455159  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0320  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.33 
 
 
356 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66250  heptosyltransferase II  27.51 
 
 
345 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1870  heptosyltransferase family protein  27.03 
 
 
352 aa  90.1  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.66 
 
 
360 aa  89.7  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0990  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.89 
 
 
346 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0832  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.89 
 
 
346 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0291  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.61 
 
 
346 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2419  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.61 
 
 
346 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0586  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.61 
 
 
346 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0366  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.07 
 
 
349 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0032  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.61 
 
 
376 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0063  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  28.47 
 
 
354 aa  88.2  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.877737  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 
400 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3136  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.86 
 
 
344 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.82 
 
 
359 aa  87.8  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4147  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  28.47 
 
 
354 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0465  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.43 
 
 
344 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2792  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.3 
 
 
362 aa  87.4  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0445733  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0069  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  28.47 
 
 
354 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270694  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2662  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  35.33 
 
 
329 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879845  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2680  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  35.33 
 
 
329 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196159  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0334  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.58 
 
 
343 aa  87  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.17 
 
 
362 aa  86.7  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.27 
 
 
343 aa  86.3  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5964  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.73 
 
 
329 aa  86.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0668  glycosyl transferase family 9  27.27 
 
 
304 aa  85.9  8e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000239845  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3035  glycosyl transferase family 9  24.64 
 
 
341 aa  85.9  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.128179 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1046  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 
335 aa  85.9  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.73 
 
 
368 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
361 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.26 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0337  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.98 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3770  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  35.98 
 
 
351 aa  83.2  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.242011  normal  0.536434 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1212  glycosyl transferase family protein  26.88 
 
 
351 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0205  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.09 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
379 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.96 
 
 
367 aa  82  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2581  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.84 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0315509  normal  0.0579279 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  24.5 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0149  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.15 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>