275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0668 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0668  glycosyl transferase family 9  100 
 
 
304 aa  612  9.999999999999999e-175  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000239845  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1515  glycosyl transferase family 9  39.06 
 
 
315 aa  211  9e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  25.86 
 
 
329 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1629  heptosyltransferase family protein  24.44 
 
 
341 aa  102  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1212  glycosyl transferase family protein  24.32 
 
 
351 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  28.22 
 
 
330 aa  99.4  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  24.37 
 
 
332 aa  95.1  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
333 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2622  glycosyl transferase family 9  24.92 
 
 
327 aa  95.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2822  glycosyl transferase family 9  24.43 
 
 
357 aa  93.6  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0093  heptosyltransferase  25.3 
 
 
335 aa  92.4  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.283951  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2827  glycosyl transferase family 9  21.68 
 
 
332 aa  92  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  27.19 
 
 
330 aa  91.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0977  glycosyl transferase family 9  26.06 
 
 
336 aa  92  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.412214  hitchhiker  0.000380468 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.76 
 
 
332 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.76 
 
 
332 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.7 
 
 
332 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0615  glycosyl transferase family 9  23.26 
 
 
388 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1683  heptosyltransferase family protein  25.24 
 
 
339 aa  84  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943397  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2512  glycosyl transferase family 9  24 
 
 
335 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.122114  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  25.9 
 
 
335 aa  82.8  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  25.24 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0145  glycosyl transferase family 9  25.55 
 
 
334 aa  79  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0787699  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4509  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.19 
 
 
358 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.984943  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2616  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.63 
 
 
346 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0161  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  24.44 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0262  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  24.44 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  26.97 
 
 
360 aa  75.9  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2581  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.55 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0315509  normal  0.0579279 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1796  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.26 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0153252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3479  glycosyl transferase family 9  23.05 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1601  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.98 
 
 
358 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0160  glycosyl transferase family 9  25.3 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.081148  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0579  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.71 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0417722 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5670  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.85 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II- LPS biosynthesis, waaF  26.32 
 
 
349 aa  73.2  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57864  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.63 
 
 
516 aa  73.2  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1297  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.63 
 
 
357 aa  73.2  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2523  glycosyl transferase family protein  21.04 
 
 
549 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0027494  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3077  glycosyl transferase family 9  23.69 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212218 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0337  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.66 
 
 
343 aa  71.2  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1613  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.91 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.938574  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.86 
 
 
343 aa  71.2  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  24.33 
 
 
344 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1430  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.22 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.433095 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001794  ADP-heptose--lipooligosaccharide heptosyltransferase II  26.74 
 
 
352 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.578647  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0138  LPS heptosyltransferase II  25.68 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0311  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.68 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000028657 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66250  heptosyltransferase II  24.64 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00680  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  27.78 
 
 
352 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.99 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5747  heptosyltransferase II  24.75 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0366  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.14 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1069  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.07 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1722  glycosyl transferase family 9  19.5 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3478  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.45 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  22.62 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0009  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.43 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4862  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.26 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0465  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.77 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0341  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.58 
 
 
349 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.455159  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0369  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.58 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.489126 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  23.62 
 
 
371 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1067  glycosyl transferase family 9  27.01 
 
 
316 aa  65.9  0.0000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000716573  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5003  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.28 
 
 
344 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  28.3 
 
 
344 aa  65.1  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  20.86 
 
 
361 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0789  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.49 
 
 
335 aa  65.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1155  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase, putative  27.24 
 
 
296 aa  63.5  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0520  glycosyl transferase family protein  23.46 
 
 
344 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3770  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.29 
 
 
351 aa  62.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.242011  normal  0.536434 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0069  glycosyl transferase family 9  23.73 
 
 
345 aa  63.2  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.960845  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.43 
 
 
343 aa  62.8  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  23.34 
 
 
409 aa  62.8  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  22.19 
 
 
357 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1433  heptosyltransferase family protein  20.18 
 
 
372 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561852  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0320  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.57 
 
 
356 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03000  heptosyltransferase  25.08 
 
 
331 aa  60.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0265488  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  26.72 
 
 
367 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.58 
 
 
353 aa  60.1  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3136  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.98 
 
 
344 aa  59.7  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1535  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.41 
 
 
346 aa  58.9  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  28.39 
 
 
348 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0357  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.66 
 
 
324 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0363758  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  22.04 
 
 
354 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1247  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.22 
 
 
339 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.313368  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0205  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.38 
 
 
331 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2792  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.64 
 
 
362 aa  58.9  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0445733  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
367 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.16 
 
 
337 aa  57.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.92 
 
 
352 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.381359 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1399  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.89 
 
 
322 aa  57  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.348076  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3808  glycosyl transferase family protein  34.69 
 
 
444 aa  56.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0801  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.65 
 
 
335 aa  56.2  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
364 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2729  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 
321 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637215  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0342  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.6 
 
 
352 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.15 
 
 
393 aa  54.7  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0470  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.79 
 
 
324 aa  54.3  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0284268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>