More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3136 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_3136  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  100 
 
 
344 aa  695    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  68.6 
 
 
344 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  60.17 
 
 
344 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.39 
 
 
516 aa  204  2e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  33.53 
 
 
330 aa  194  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  35.07 
 
 
344 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.81 
 
 
359 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.35 
 
 
348 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1683  heptosyltransferase family protein  30.36 
 
 
339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943397  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.02 
 
 
359 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  28.15 
 
 
329 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3479  glycosyl transferase family 9  30.3 
 
 
342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  30.35 
 
 
343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  29.55 
 
 
360 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0582  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.55 
 
 
325 aa  125  8.000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000000638797  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.61 
 
 
343 aa  122  9e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0337  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.61 
 
 
343 aa  121  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  29.86 
 
 
341 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.41 
 
 
343 aa  117  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.68 
 
 
332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.68 
 
 
332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  27.96 
 
 
354 aa  116  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0491  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.02 
 
 
354 aa  116  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.69 
 
 
332 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.28 
 
 
341 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.28 
 
 
341 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.36 
 
 
299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.22 
 
 
352 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1283  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.55 
 
 
316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0326362  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  28.01 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1629  heptosyltransferase family protein  31.55 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  27.24 
 
 
360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0768  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.32 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  23.51 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.62 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3035  glycosyl transferase family 9  29.53 
 
 
341 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.128179 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
361 aa  110  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  27.6 
 
 
334 aa  109  8.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0580  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.94 
 
 
316 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.604166  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1805  glycosyl transferase family 9  36.2 
 
 
308 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1226  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.19 
 
 
304 aa  107  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.56987e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0160  glycosyl transferase family 9  29.45 
 
 
345 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.081148  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  30.03 
 
 
356 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0093  heptosyltransferase  27.62 
 
 
335 aa  107  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.283951  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  27.3 
 
 
332 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0615  glycosyl transferase family 9  39.18 
 
 
388 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1164  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.25 
 
 
317 aa  107  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1237  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.3 
 
 
314 aa  107  4e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2622  glycosyl transferase family 9  26.09 
 
 
327 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1067  glycosyl transferase family 9  26.04 
 
 
316 aa  105  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000716573  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3478  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.36 
 
 
334 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.56 
 
 
361 aa  102  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2616  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.37 
 
 
346 aa  102  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5003  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.55 
 
 
344 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  29.11 
 
 
361 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1433  heptosyltransferase family protein  27.27 
 
 
372 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561852  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0282  glycosyl transferase family 9  27.11 
 
 
350 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.24 
 
 
367 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0334  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.14 
 
 
343 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1231  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.07 
 
 
356 aa  101  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001794  ADP-heptose--lipooligosaccharide heptosyltransferase II  23.5 
 
 
352 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.578647  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3562  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 
326 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  24.47 
 
 
324 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1535  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.41 
 
 
346 aa  100  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00680  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  23.21 
 
 
352 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0545  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.65 
 
 
340 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0086605  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.03 
 
 
352 aa  100  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II- LPS biosynthesis, waaF  26.74 
 
 
349 aa  99.8  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57864  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0465  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.86 
 
 
344 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0161  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  22.57 
 
 
356 aa  98.6  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0520  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 
344 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0262  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  22.57 
 
 
356 aa  98.6  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2827  glycosyl transferase family 9  24.12 
 
 
332 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  26.05 
 
 
779 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.44 
 
 
356 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1613  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  37.25 
 
 
358 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.938574  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0366  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.28 
 
 
349 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.44 
 
 
356 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.01 
 
 
346 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.44 
 
 
356 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4862  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.43 
 
 
349 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1991  glycosyl transferase family protein  28.41 
 
 
351 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.010394  normal  0.201882 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.44 
 
 
356 aa  96.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.1 
 
 
356 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0369  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25 
 
 
349 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.489126 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2792  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.59 
 
 
362 aa  96.7  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0445733  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0341  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25 
 
 
349 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.455159  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0899  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.08 
 
 
354 aa  96.3  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0311  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.98 
 
 
376 aa  95.5  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000028657 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0138  LPS heptosyltransferase II  26.98 
 
 
369 aa  95.5  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0579  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.14 
 
 
347 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0417722 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1601  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  36.76 
 
 
358 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.81 
 
 
368 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.77 
 
 
352 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.57 
 
 
360 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.48 
 
 
362 aa  94.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0145  glycosyl transferase family 9  28.05 
 
 
334 aa  94.4  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0787699  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2822  glycosyl transferase family 9  27.07 
 
 
357 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0320  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  36.69 
 
 
356 aa  94.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>