More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0145 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0145  glycosyl transferase family 9  100 
 
 
334 aa  682    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0787699  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  63.17 
 
 
333 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  59.04 
 
 
332 aa  412  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  56.85 
 
 
334 aa  379  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0160  glycosyl transferase family 9  57.36 
 
 
345 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.081148  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  56.63 
 
 
335 aa  365  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0093  heptosyltransferase  53.03 
 
 
335 aa  347  2e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.283951  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2622  glycosyl transferase family 9  35.58 
 
 
327 aa  192  9e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  33.44 
 
 
324 aa  182  8.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  34.89 
 
 
329 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2827  glycosyl transferase family 9  30.43 
 
 
332 aa  152  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  27.61 
 
 
330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  28.06 
 
 
330 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  27.17 
 
 
344 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.73 
 
 
516 aa  120  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.44 
 
 
332 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.44 
 
 
332 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.53 
 
 
332 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  25.94 
 
 
344 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1683  heptosyltransferase family protein  30.21 
 
 
339 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943397  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27 
 
 
348 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 
344 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.05 
 
 
339 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  30.97 
 
 
360 aa  97.1  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3479  glycosyl transferase family 9  27.62 
 
 
342 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  32.21 
 
 
371 aa  94.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0320  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  37.66 
 
 
356 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  26.04 
 
 
347 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  30.98 
 
 
357 aa  92  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1515  glycosyl transferase family 9  24.92 
 
 
315 aa  91.3  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II- LPS biosynthesis, waaF  36.05 
 
 
349 aa  90.5  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57864  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.43 
 
 
343 aa  90.5  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1722  glycosyl transferase family 9  24.43 
 
 
350 aa  89.7  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2822  glycosyl transferase family 9  24.79 
 
 
357 aa  89.7  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5003  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  35.22 
 
 
344 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0520  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
344 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66250  heptosyltransferase II  34.59 
 
 
345 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1212  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 
351 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0369  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.33 
 
 
349 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.489126 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3077  glycosyl transferase family 9  26.35 
 
 
355 aa  87  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212218 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.87 
 
 
362 aa  86.7  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  35.12 
 
 
341 aa  85.9  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4862  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.12 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0334  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.7 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0341  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.75 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.455159  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2581  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.13 
 
 
332 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0315509  normal  0.0579279 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5747  heptosyltransferase II  33.96 
 
 
345 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.52 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.55 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0366  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.16 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1629  heptosyltransferase family protein  27.82 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1805  glycosyl transferase family 9  25.91 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.02 
 
 
352 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.42 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  27.12 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0977  glycosyl transferase family 9  26.07 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.412214  hitchhiker  0.000380468 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  25.97 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0172  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  27.81 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.063279  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3136  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  35.44 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0069  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  28.86 
 
 
354 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270694  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0454  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.96 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  0.709845 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4147  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  28.86 
 
 
354 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0063  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  28.52 
 
 
354 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.877737  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  22.86 
 
 
409 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  27.04 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2792  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  35.06 
 
 
362 aa  78.2  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0445733  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.3 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0205  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.86 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0032  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.18 
 
 
376 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2616  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.14 
 
 
346 aa  77  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0990  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.33 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0658  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.55 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0832  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.33 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0768  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.54 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0491  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.21 
 
 
354 aa  76.6  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2553  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.69 
 
 
345 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0615  glycosyl transferase family 9  25.6 
 
 
388 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.3 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2415  glycosyl transferase family 9  23.64 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0888849  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.07 
 
 
393 aa  75.5  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.51 
 
 
343 aa  75.5  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0665  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.69 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0291  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.05 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  25.89 
 
 
349 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0465  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.26 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0149  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.89 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2419  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.05 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0586  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.05 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  25.14 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00680  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  23.66 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  25.53 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5964  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.33 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0579  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.82 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0417722 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2022  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.33 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2680  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.33 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196159  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2633  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.33 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609317  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3033  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.84 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2662  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.33 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879845  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.12 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.84327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>