More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1991 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1991  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
351 aa  713    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.010394  normal  0.201882 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3035  glycosyl transferase family 9  66.96 
 
 
341 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.128179 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1433  heptosyltransferase family protein  55.01 
 
 
372 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561852  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0282  glycosyl transferase family 9  53.57 
 
 
350 aa  353  2e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0229  glycosyl transferase family 9  51.23 
 
 
348 aa  339  5e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.73 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.88 
 
 
361 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  32.36 
 
 
344 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.57 
 
 
360 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.36 
 
 
352 aa  103  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.18 
 
 
352 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  21.78 
 
 
330 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.18 
 
 
352 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.18 
 
 
352 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.18 
 
 
352 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.45 
 
 
361 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  29.11 
 
 
344 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.26 
 
 
356 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.54 
 
 
339 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.26 
 
 
356 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.26 
 
 
356 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.26 
 
 
356 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.26 
 
 
356 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  26.51 
 
 
335 aa  97.8  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.56 
 
 
367 aa  97.1  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.4 
 
 
348 aa  97.1  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  26.54 
 
 
350 aa  95.5  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.46 
 
 
340 aa  94  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.46 
 
 
340 aa  94  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  26.46 
 
 
340 aa  94  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  25.3 
 
 
360 aa  93.6  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.84 
 
 
343 aa  90.9  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1403  putative heptosyltransferase III waaq  21.6 
 
 
356 aa  90.5  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.308915  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  25.66 
 
 
330 aa  88.6  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.18 
 
 
332 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.18 
 
 
332 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0626  glycosyl transferase family protein  22.54 
 
 
340 aa  88.6  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0429094  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1683  heptosyltransferase family protein  22.71 
 
 
339 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943397  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.43 
 
 
353 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3033  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 
348 aa  87.4  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.26 
 
 
356 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.85 
 
 
367 aa  87.8  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2520  glycosyl transferase family protein  21.25 
 
 
354 aa  87.4  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.38 
 
 
362 aa  87  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1297  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.39 
 
 
357 aa  86.7  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.27 
 
 
356 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3136  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.54 
 
 
344 aa  85.9  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2876  hypothetical protein  22.58 
 
 
359 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.43 
 
 
359 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1870  heptosyltransferase family protein  26.95 
 
 
352 aa  85.1  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  26.33 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.79 
 
 
332 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3404  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.88 
 
 
351 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.55 
 
 
389 aa  84  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0576  glycosyl transferase family protein  24.78 
 
 
331 aa  84  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0093  heptosyltransferase  24.07 
 
 
335 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.283951  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 
361 aa  83.2  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.17 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  25.66 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.99 
 
 
359 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.63 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00459  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  22.86 
 
 
359 aa  79.3  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0491  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.28 
 
 
354 aa  79.3  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2581  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.49 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0315509  normal  0.0579279 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.72 
 
 
350 aa  77  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  23.43 
 
 
344 aa  77  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0371  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 
378 aa  76.3  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1808  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.08 
 
 
327 aa  75.9  0.0000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  24.65 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  23.38 
 
 
779 aa  75.5  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  24.46 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1069  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.28 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.25 
 
 
516 aa  74.3  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.6 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  21.64 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0851  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.53 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2415  glycosyl transferase family 9  23.12 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0888849  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  25.95 
 
 
337 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0545  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.84 
 
 
340 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0086605  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  23.96 
 
 
361 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  27.54 
 
 
357 aa  72  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4092  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.09 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102262  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1601  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.4 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0949  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.26 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06145  hypothetical protein  21.07 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.871394  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  24.78 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  24.85 
 
 
341 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.01 
 
 
341 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0162  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 
319 aa  69.3  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2252  heptosyltransferase family protein  23.75 
 
 
370 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.548459  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  25.23 
 
 
349 aa  68.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.69 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2331  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.91 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000713254  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1515  glycosyl transferase family 9  21.92 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.68 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.89 
 
 
392 aa  67  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0160  glycosyl transferase family 9  23.51 
 
 
345 aa  67  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.081148  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0510  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.08 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0989  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.08 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0259349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>