More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0576 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0576  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
331 aa  678    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1870  heptosyltransferase family protein  30.18 
 
 
352 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.22 
 
 
348 aa  125  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.98 
 
 
343 aa  122  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.14 
 
 
359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.65 
 
 
339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  29.48 
 
 
344 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  25.43 
 
 
360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  28.78 
 
 
779 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.31 
 
 
362 aa  110  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  27.38 
 
 
350 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.22 
 
 
359 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.97 
 
 
352 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 
347 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.01 
 
 
352 aa  103  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  25.51 
 
 
330 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.36 
 
 
516 aa  101  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  23.67 
 
 
330 aa  99.8  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  27.56 
 
 
361 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.84 
 
 
360 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  26.87 
 
 
344 aa  97.1  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.74 
 
 
332 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.74 
 
 
332 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.28 
 
 
332 aa  95.9  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
323 aa  95.1  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 
344 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  28.12 
 
 
354 aa  93.6  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  28.7 
 
 
337 aa  90.9  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3033  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 
348 aa  90.9  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.07 
 
 
368 aa  90.9  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.21 
 
 
360 aa  89.4  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0851  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.78 
 
 
346 aa  89.4  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1688  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 
318 aa  87.4  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.01 
 
 
353 aa  86.7  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 
364 aa  85.9  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1535  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.36 
 
 
346 aa  83.6  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1067  glycosyl transferase family 9  24.18 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000716573  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  24.62 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24 
 
 
343 aa  81.6  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3214  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.89 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0491  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.9 
 
 
354 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3035  glycosyl transferase family 9  25.08 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.128179 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0282  glycosyl transferase family 9  26.39 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2148  glycosyl transferase family 9  31.56 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.445366  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2331  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.78 
 
 
366 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000713254  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3404  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.92 
 
 
351 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  25.07 
 
 
354 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0009  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.24 
 
 
349 aa  78.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2252  heptosyltransferase family protein  24.16 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.548459  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0391  glycosyl transferase family 9  23.69 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0900723  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  24.85 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3136  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.14 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.21 
 
 
367 aa  77.4  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.43 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  24.86 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.08 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4735  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.96684 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.93 
 
 
341 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3479  glycosyl transferase family 9  27.36 
 
 
342 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1283  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.32 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0326362  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  25.71 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3375  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0607  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1164  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.48 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2581  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.82 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0315509  normal  0.0579279 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  20.93 
 
 
409 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1991  glycosyl transferase family protein  24.78 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.010394  normal  0.201882 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.12 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0510  glycosyl transferase family 9  21.94 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.29 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  25.71 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  23.41 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.31 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1231  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  21.79 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.86 
 
 
393 aa  73.2  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1515  glycosyl transferase family 9  22.96 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0069  glycosyl transferase family 9  23.31 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.960845  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00459  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  24.65 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  24.73 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2022  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.27 
 
 
345 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2633  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.27 
 
 
345 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609317  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  24.73 
 
 
351 aa  72  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2553  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.48 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  24.86 
 
 
335 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0454  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.93 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  0.709845 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.88 
 
 
361 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0580  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.55 
 
 
316 aa  72  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.604166  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.32 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2242  heptosyltransferase family protein  23.8 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  24.14 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.43 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0665  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.48 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1100  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  23.62 
 
 
353 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000330109  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  27.58 
 
 
363 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  23.29 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2662  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.73 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879845  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1683  heptosyltransferase family protein  25.35 
 
 
339 aa  70.5  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943397  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2680  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.99 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196159  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1385  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.95 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>