More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0371 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0371  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
378 aa  777    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0162  glycosyl transferase family protein  36.98 
 
 
319 aa  190  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4835  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
337 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0140311  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.64 
 
 
348 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1407  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 
306 aa  123  4e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.191026  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4096  glycosyl transferase family 9  30 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.190613  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0626  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0429094  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.53 
 
 
343 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.44 
 
 
360 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.76 
 
 
360 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.59 
 
 
368 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.56 
 
 
359 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3691  heptosyltransferase family protein  27.79 
 
 
326 aa  99  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0262  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
326 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3934  heptosyltransferase family protein  27.76 
 
 
326 aa  98.6  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  27.36 
 
 
349 aa  90.1  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
403 aa  89.7  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1231  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.75 
 
 
356 aa  89.7  8e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3516  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.14 
 
 
387 aa  88.6  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.45 
 
 
359 aa  88.6  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3647  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.14 
 
 
397 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0852  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.14 
 
 
387 aa  87.4  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5654  glycosyl transferase family protein  26.59 
 
 
381 aa  87  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  25.46 
 
 
361 aa  86.7  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  23.15 
 
 
409 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.29 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3562  glycosyl transferase family protein  27.81 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.29 
 
 
356 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.29 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0229  glycosyl transferase family 9  27.48 
 
 
348 aa  84  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.29 
 
 
356 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.53 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  25.82 
 
 
371 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3702  glycosyl transferase family 9  26.45 
 
 
408 aa  82.8  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.61 
 
 
352 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.97 
 
 
356 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.61 
 
 
352 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.61 
 
 
352 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.61 
 
 
352 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  25.77 
 
 
357 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.61 
 
 
352 aa  81.6  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.22 
 
 
339 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2231  glycosyl transferase family protein  26 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338321  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.23 
 
 
346 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  26.61 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3628  glycosyl transferase family 9  26.16 
 
 
362 aa  79.7  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0473  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25 
 
 
356 aa  79.3  0.00000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.189899  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.44 
 
 
340 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.44 
 
 
340 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  24.44 
 
 
340 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  29.27 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.77 
 
 
332 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  26.67 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2725  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
346 aa  77  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.756386  normal  0.0898734 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.32 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3214  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.99 
 
 
346 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.11 
 
 
352 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.28 
 
 
393 aa  75.5  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0454  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.87 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  0.709845 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1700  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  23.37 
 
 
779 aa  74.3  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2312  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.09 
 
 
361 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.81 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.81 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.22 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3033  glycosyl transferase family protein  23.95 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.62 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  28.29 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  23.77 
 
 
360 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2415  glycosyl transferase family protein  23.42 
 
 
319 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000869235  hitchhiker  0.0000149362 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1535  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.46 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.08 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2335  glycosyl transferase family protein  25.07 
 
 
362 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0499927 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.26 
 
 
389 aa  71.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0832  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.23 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0990  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.23 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.68 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 
406 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  23.27 
 
 
367 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2419  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.25 
 
 
346 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0291  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.25 
 
 
346 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0032  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.25 
 
 
376 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0586  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.25 
 
 
346 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  21.1 
 
 
379 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0658  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.57 
 
 
346 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  25.9 
 
 
344 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  21.38 
 
 
354 aa  67.8  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  24.61 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2604  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.19 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00142989  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1991  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 
351 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.010394  normal  0.201882 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0393  glycosyl transferase family protein  23.4 
 
 
385 aa  67  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.326109  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2224  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25 
 
 
340 aa  67  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112899  normal  0.0907149 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 
347 aa  67  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.16 
 
 
352 aa  67  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2252  heptosyltransferase family protein  23.36 
 
 
370 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.548459  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0851  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.62 
 
 
346 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>