294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3934 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0262  glycosyl transferase family protein  99.39 
 
 		 326 aa  665    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3934  heptosyltransferase family protein  100 
 
 		 326 aa  669    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3691  heptosyltransferase family protein  98.77 
 
 		 326 aa  661    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4096  glycosyl transferase family 9  59.13 
 
 		 324 aa  421  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.190613  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5654  glycosyl transferase family protein  59.88 
 
 		 381 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2335  glycosyl transferase family protein  59.88 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0499927 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1700  glycosyl transferase family protein  59.38 
 
 		 364 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2312  glycosyl transferase family protein  59.38 
 
 		 364 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2351  glycosyl transferase family protein  58.9 
 
 		 364 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2231  glycosyl transferase family protein  58.59 
 
 		 364 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0162  glycosyl transferase family protein  31.66 
 
 		 319 aa  143  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4835  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 		 337 aa  99.4  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0140311  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0371  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 		 378 aa  98.6  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  27.81 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0354  glycosyl transferase family 9  24.62 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0386  glycosyl transferase family 9  24.1 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1407  glycosyl transferase family protein  21.05 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.191026  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  25 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.97 
 
 		 516 aa  73.9  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  25.24 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.91 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  25.62 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.44 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.04 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.04 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.04 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.04 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.63 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  27.33 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1474  heptosyltransferase  22.55 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.379549  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0607  glycosyl transferase family protein  25.15 
 
 		 386 aa  67  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0360  glycosyl transferase family protein  23.94 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.987967  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  25.08 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.73 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.64 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.64 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.78 
 
 		 332 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.64 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.64 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.78 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.78 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.83 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.29 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.3 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.33 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0281  glycosyl transferase family 9  22.36 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.69 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0851  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.82 
 
 		 346 aa  62.4  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  25.76 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0470  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.6 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0284268  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 		 361 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3977  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.67 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3214  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.61 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0626  glycosyl transferase family protein  22.26 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0429094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1248  glycosyl transferase family 9  24.7 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9727 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.1 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1794  heptosyltransferase  21.65 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0140339 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1430  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.87 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.433095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.23 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  21.61 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.8 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4830  glycosyl transferase family protein  23.61 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.244067  hitchhiker  0.0000484932 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  21.45 
 
 		 348 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3628  glycosyl transferase family 9  26.78 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1791  heptosyltransferase  20.72 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00189607 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3104  glycosyl transferase family 9  18.55 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000940717  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3562  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  26.35 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5042  glycosyl transferase family 9  23.3 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502044  normal  0.0534111 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.08 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.08 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  22.08 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.4 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  24.27 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.5 
 
 		 350 aa  57  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0009  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.57 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0579  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.4 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0417722 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.61 
 
 		 361 aa  55.8  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0852  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.8 
 
 		 387 aa  55.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1629  heptosyltransferase family protein  24.46 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  22.91 
 
 		 371 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1683  heptosyltransferase family protein  24.5 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2725  glycosyl transferase family protein  24 
 
 		 346 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.756386  normal  0.0898734 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4862  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.14 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3702  glycosyl transferase family 9  26.62 
 
 		 408 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.81 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5003  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.92 
 
 		 344 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3011  glycosyl transferase family protein  24.93 
 
 		 381 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169965  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 		 400 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0789  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.83 
 
 		 335 aa  53.9  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1707  glycosyl transferase family 9  25.73 
 
 		 322 aa  53.9  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0479  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.22 
 
 		 317 aa  53.5  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  22.48 
 
 		 330 aa  53.9  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3033  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 348 aa  53.9  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>