More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2604 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2604  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  100 
 
 
345 aa  710    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00142989  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0327  glycosyl transferase family protein  55.69 
 
 
339 aa  362  5.0000000000000005e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0012  glycosyl transferase family protein  50.74 
 
 
356 aa  330  3e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0568378  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0585  heptosyltransferase-like protein  36.53 
 
 
322 aa  189  8e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000371878  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3928  ADP-heptose--lipooligosaccharide heptosyltransferase III  34.01 
 
 
333 aa  188  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0263  glycosyl transferase family 9  36.99 
 
 
320 aa  186  5e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.951367  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3693  ADP-heptose--lipooligosaccharide heptosyltransferase III  35.17 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0626  glycosyl transferase family protein  33.44 
 
 
340 aa  151  2e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0429094  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  27.94 
 
 
361 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.01 
 
 
359 aa  84  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 
405 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  23.82 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  25.08 
 
 
401 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  25.95 
 
 
779 aa  83.2  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  25.08 
 
 
401 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  25.08 
 
 
401 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  26.84 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0899  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.22 
 
 
354 aa  79.7  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.58 
 
 
382 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.28 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.83 
 
 
393 aa  77.4  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5042  glycosyl transferase family 9  26.58 
 
 
372 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502044  normal  0.0534111 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.76 
 
 
343 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2559  glycosyl transferase family protein  25.43 
 
 
343 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1535  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.38 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3108  glycosyl transferase family 9  28.21 
 
 
358 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  26.89 
 
 
356 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0162  glycosyl transferase family protein  25.85 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 
390 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.15 
 
 
516 aa  70.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6399  glycosyl transferase family protein  23.1 
 
 
400 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.0454867 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 
361 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  28.21 
 
 
361 aa  70.1  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  23.1 
 
 
400 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.86 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.93 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3111  glycosyl transferase family 9  23.4 
 
 
356 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  26.37 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.41 
 
 
367 aa  68.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.78 
 
 
360 aa  67  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0473  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.01 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.189899  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0371  glycosyl transferase family protein  24.19 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  25.51 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1824  glycosyl transferase family 9  27.27 
 
 
390 aa  66.2  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.68 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
357 aa  66.2  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.68 
 
 
341 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.87 
 
 
367 aa  65.9  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  24.41 
 
 
347 aa  65.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3929  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  23.89 
 
 
348 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3910  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  23.89 
 
 
348 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0446452 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3991  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  23.89 
 
 
348 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4036  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  23.89 
 
 
348 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
344 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0116  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  23.91 
 
 
348 aa  64.7  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0545  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.94 
 
 
340 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0086605  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1601  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.52 
 
 
358 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22 
 
 
352 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4097  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  23.89 
 
 
348 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5595  glycosyl transferase family 9  25.75 
 
 
356 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421623  normal  0.389921 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0085  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.1 
 
 
348 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000038978  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3831  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  23.1 
 
 
348 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000276456  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4047  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  23.1 
 
 
348 aa  63.5  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000910947  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4123  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  23.1 
 
 
348 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0437858  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3957  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  23.1 
 
 
348 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000313085  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4993  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  23.1 
 
 
348 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211589  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0089  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  23.1 
 
 
348 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000834595  normal  0.156713 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0307  glycosyl transferase family 9  25.76 
 
 
374 aa  63.2  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.92 
 
 
337 aa  63.2  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 
344 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2725  glycosyl transferase family protein  25.07 
 
 
346 aa  63.2  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.756386  normal  0.0898734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 
318 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.75 
 
 
343 aa  62.8  0.000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.03 
 
 
348 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03477  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  23.32 
 
 
348 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000025219  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0337  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.07 
 
 
343 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.62 
 
 
360 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03428  hypothetical protein  23.32 
 
 
348 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000123646  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  25.8 
 
 
347 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0159  glycosyl transferase family protein  24.32 
 
 
381 aa  61.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5670  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.49 
 
 
354 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2661  glycosyl transferase family 9  22.37 
 
 
320 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141025 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00662  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase III  21.68 
 
 
351 aa  60.1  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.98 
 
 
368 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 
347 aa  60.1  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.92 
 
 
356 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5003  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.66 
 
 
344 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 
323 aa  59.7  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  22.82 
 
 
368 aa  59.7  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1613  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.04 
 
 
358 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.938574  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  25.16 
 
 
356 aa  59.3  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0341  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.63 
 
 
349 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.455159  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  24.44 
 
 
357 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0520  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 
344 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  25.16 
 
 
373 aa  58.9  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  22.61 
 
 
400 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4862  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.79 
 
 
349 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.24 
 
 
346 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  25.8 
 
 
340 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  26.71 
 
 
360 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>