202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2312 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1700  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
364 aa  731    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2335  glycosyl transferase family protein  98.34 
 
 
362 aa  713    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0499927 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2312  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
364 aa  731    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5654  glycosyl transferase family protein  89.34 
 
 
381 aa  578  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2231  glycosyl transferase family protein  80.77 
 
 
364 aa  547  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338321  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2351  glycosyl transferase family protein  80.49 
 
 
364 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3691  heptosyltransferase family protein  59.38 
 
 
326 aa  401  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0262  glycosyl transferase family protein  59.38 
 
 
326 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3934  heptosyltransferase family protein  59.38 
 
 
326 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4096  glycosyl transferase family 9  51.54 
 
 
324 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.190613  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0162  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
319 aa  124  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0371  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 
378 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4835  glycosyl transferase family protein  24.36 
 
 
337 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0140311  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.15 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  27.33 
 
 
352 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
379 aa  79.7  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  29.14 
 
 
400 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1407  glycosyl transferase family protein  23 
 
 
306 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.191026  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  26.98 
 
 
354 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  29.14 
 
 
401 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.57 
 
 
359 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  26.22 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  28.53 
 
 
405 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3628  glycosyl transferase family 9  29.83 
 
 
362 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.46 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.46 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  27.51 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  24.49 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3562  glycosyl transferase family protein  29.83 
 
 
326 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.91 
 
 
367 aa  67  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.38 
 
 
382 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.19 
 
 
352 aa  66.2  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.67 
 
 
332 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  28.43 
 
 
363 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  24.09 
 
 
361 aa  63.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3702  glycosyl transferase family 9  29.49 
 
 
408 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  23.75 
 
 
344 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 
403 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.55 
 
 
352 aa  63.2  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
406 aa  63.2  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1248  glycosyl transferase family 9  23.33 
 
 
385 aa  62.4  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.9727 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1403  putative heptosyltransferase III waaq  22.29 
 
 
356 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.308915  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.58 
 
 
353 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.21 
 
 
362 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.35 
 
 
350 aa  62  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25 
 
 
367 aa  61.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.03 
 
 
356 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  24.61 
 
 
332 aa  60.5  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.03 
 
 
356 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.03 
 
 
356 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.03 
 
 
356 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1707  glycosyl transferase family 9  27.24 
 
 
322 aa  60.1  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22 
 
 
356 aa  59.7  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6399  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
400 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.0454867 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.96 
 
 
356 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  22.33 
 
 
351 aa  58.9  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4830  glycosyl transferase family protein  23.45 
 
 
363 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.244067  hitchhiker  0.0000484932 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  22.33 
 
 
351 aa  58.2  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  25.47 
 
 
364 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1791  heptosyltransferase  23.05 
 
 
360 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00189607 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.4 
 
 
339 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.87 
 
 
393 aa  57.4  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  28.43 
 
 
392 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  26.17 
 
 
371 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0987  glycosyl transferase family 9  25.94 
 
 
381 aa  57.4  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00906939 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  21.88 
 
 
344 aa  57  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  24.44 
 
 
367 aa  56.2  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3149  glycosyl transferase family protein  23.18 
 
 
366 aa  56.2  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.15 
 
 
352 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0473  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.55 
 
 
356 aa  55.5  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.189899  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.15 
 
 
352 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.15 
 
 
352 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  26.6 
 
 
357 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  22.15 
 
 
354 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1231  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.83 
 
 
356 aa  54.7  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 
368 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.15 
 
 
352 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0386  glycosyl transferase family 9  22.84 
 
 
350 aa  53.9  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  25.85 
 
 
400 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  19.5 
 
 
516 aa  53.1  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0607  glycosyl transferase family protein  23.87 
 
 
386 aa  52.8  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0393  glycosyl transferase family protein  22.09 
 
 
385 aa  52.8  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.326109  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0899  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.12 
 
 
354 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.57 
 
 
343 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0626  glycosyl transferase family protein  21.96 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0429094  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 
409 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0670  ADP-heptoselps heptosyltransferase  24.61 
 
 
365 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.374437  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.48 
 
 
390 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  26.48 
 
 
390 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0851  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.07 
 
 
346 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  36.84 
 
 
389 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  26.48 
 
 
390 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  26.48 
 
 
390 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  26.1 
 
 
381 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  26.48 
 
 
390 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>