More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3702 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3702  glycosyl transferase family 9  100 
 
 
408 aa  771    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3628  glycosyl transferase family 9  95.57 
 
 
362 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3562  glycosyl transferase family protein  94.77 
 
 
326 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  75.14 
 
 
403 aa  498  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  32.45 
 
 
361 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  29.77 
 
 
360 aa  99  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.63 
 
 
359 aa  97.4  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  29.21 
 
 
344 aa  97.1  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  29.31 
 
 
367 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.89 
 
 
359 aa  96.3  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  28.57 
 
 
348 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.58 
 
 
356 aa  94  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  31.51 
 
 
371 aa  94  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  31.99 
 
 
400 aa  92.8  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  34.22 
 
 
368 aa  91.3  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 
358 aa  90.5  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.42 
 
 
352 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25 
 
 
356 aa  89  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.42 
 
 
352 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.42 
 
 
352 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5589  glycosyl transferase family 9  26.54 
 
 
334 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.69 
 
 
348 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.79 
 
 
352 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1707  glycosyl transferase family 9  39.13 
 
 
322 aa  88.6  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  32.85 
 
 
344 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.1 
 
 
352 aa  87.4  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3977  glycosyl transferase family protein  37.85 
 
 
376 aa  87  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67849  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.45 
 
 
367 aa  87  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
379 aa  86.3  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0371  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
378 aa  86.3  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.87 
 
 
352 aa  86.7  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  23.72 
 
 
330 aa  86.3  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.64 
 
 
340 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  26.23 
 
 
340 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.64 
 
 
340 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  34.27 
 
 
363 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  28.77 
 
 
357 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5041  glycosyl transferase family 9  27.3 
 
 
326 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.330457  normal  0.05523 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3167  putative heptosyltransferase  31.96 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  27.03 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1385  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  32.3 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.55 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3038  putative heptosyltransferase  31.96 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  33.12 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 
405 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.97 
 
 
343 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  33.99 
 
 
381 aa  84  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.9 
 
 
389 aa  84  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  42.28 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  29.75 
 
 
354 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1009  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  31.62 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1297  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  31.62 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161852  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2273  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  31.62 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0964194  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  28.33 
 
 
779 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  41.89 
 
 
332 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  35.64 
 
 
332 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 
400 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  41.89 
 
 
332 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  29.61 
 
 
352 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  33.64 
 
 
356 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  28.72 
 
 
349 aa  81.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1433  heptosyltransferase family protein  29.11 
 
 
372 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561852  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  32.23 
 
 
401 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  32.23 
 
 
401 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0738  putative LPS biosynthesis related glycosyltransferase  32.31 
 
 
347 aa  80.1  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0359  glycosyl transferase family protein  36.52 
 
 
402 aa  80.1  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1986  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  38.12 
 
 
338 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.46 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 
367 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3214  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.71 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  26.56 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6399  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
400 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.0454867 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0229  glycosyl transferase family 9  27.85 
 
 
348 aa  79  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.42 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
358 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.42 
 
 
356 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  29.45 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
336 aa  78.2  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.42 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.42 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 
347 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.42 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  28.76 
 
 
458 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.24 
 
 
361 aa  77  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  43.12 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1297  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  44.66 
 
 
357 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.29 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  39.82 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
358 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0661  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.49 
 
 
336 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.796134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1567  glycosyl transferase family 9  46.23 
 
 
358 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.029243 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  38.12 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0567  glycosyl transferase family 9  43 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1601  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  41.35 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  38.12 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0849  glycosyl transferase family 9  29.14 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1403  putative heptosyltransferase III waaq  22.52 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.308915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>