More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5248 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
400 aa  810    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  50.56 
 
 
382 aa  355  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  53.69 
 
 
393 aa  348  8e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  54.92 
 
 
405 aa  347  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  53.89 
 
 
415 aa  342  7e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  56.42 
 
 
401 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  56.42 
 
 
401 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  56.42 
 
 
401 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  55.8 
 
 
400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6399  glycosyl transferase family protein  54.79 
 
 
400 aa  318  9e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.0454867 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3806  glycosyl transferase family 9  50 
 
 
403 aa  308  8e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4883  glycosyl transferase family 9  50 
 
 
403 aa  308  8e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  0.0526108 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1791  glycosyl transferase family protein  46.3 
 
 
408 aa  268  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306314  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3108  glycosyl transferase family 9  46.44 
 
 
358 aa  262  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5595  glycosyl transferase family 9  44.09 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421623  normal  0.389921 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5042  glycosyl transferase family 9  42.09 
 
 
372 aa  238  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502044  normal  0.0534111 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  38.53 
 
 
361 aa  236  6e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  36.16 
 
 
348 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  35.21 
 
 
367 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  36.44 
 
 
344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1300  heptosyltransferase family protein  55.29 
 
 
625 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2276  heptosyltransferase family protein  55.29 
 
 
622 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1989  heptosyltransferase family protein  55.29 
 
 
625 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1388  heptosyltransferase family protein  55.29 
 
 
643 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356236  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1012  heptosyltransferase family protein  55.29 
 
 
628 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3170  heptosyltransferase family protein  55.29 
 
 
622 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3041  heptosyltransferase family protein  55.29 
 
 
622 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1760  HAD superfamily hydrolase  34.2 
 
 
593 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.87 
 
 
352 aa  132  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1571  glycosyl transferase family 9  34.53 
 
 
338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 
382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  33.82 
 
 
343 aa  126  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.62 
 
 
343 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0353  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
357 aa  122  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1746  HAD superfamily hydrolase  36.29 
 
 
593 aa  122  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0409111 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0457  glycosyl transferase family 9  34.78 
 
 
341 aa  116  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.68138  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0567  glycosyl transferase family 9  28.2 
 
 
362 aa  113  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.86 
 
 
360 aa  113  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.36 
 
 
348 aa  112  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  29.83 
 
 
356 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4862  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.11 
 
 
349 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  32.97 
 
 
362 aa  111  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.52 
 
 
359 aa  110  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5670  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.51 
 
 
354 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0341  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.45 
 
 
349 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.455159  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0369  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.45 
 
 
349 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.489126 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 
390 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0897  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  32.19 
 
 
467 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29463  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.45 
 
 
341 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  29.45 
 
 
341 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
358 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 
379 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II- LPS biosynthesis, waaF  27.93 
 
 
349 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57864  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0454  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.98 
 
 
341 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  0.709845 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
368 aa  107  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0366  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.16 
 
 
349 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0520  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
344 aa  106  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
358 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1069  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.72 
 
 
356 aa  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
364 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1297  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.92 
 
 
357 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5003  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.84 
 
 
344 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  25.93 
 
 
360 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.61 
 
 
341 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.23 
 
 
346 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1381  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
362 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6448  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
362 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776899  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.17 
 
 
359 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.33 
 
 
341 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66250  heptosyltransferase II  26.32 
 
 
345 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  28.9 
 
 
341 aa  100  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6040  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
362 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.511032  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2459  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase, glycosyl transferase, family 9  29.66 
 
 
398 aa  99.8  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262404  normal  0.245391 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0832  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.23 
 
 
346 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0990  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.23 
 
 
346 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0465  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.95 
 
 
344 aa  99  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  32.05 
 
 
381 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2273  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  30.43 
 
 
371 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0964194  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11250  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  33.7 
 
 
360 aa  98.6  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.706344  normal  0.204518 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1385  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  30.43 
 
 
371 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1297  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  30.43 
 
 
371 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161852  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5747  heptosyltransferase II  26.32 
 
 
345 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3167  putative heptosyltransferase  30.43 
 
 
371 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3038  putative heptosyltransferase  30.43 
 
 
371 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0032  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.93 
 
 
376 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.14 
 
 
368 aa  97.4  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0658  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.81 
 
 
346 aa  97.4  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2553  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.77 
 
 
345 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2022  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.29 
 
 
345 aa  96.3  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2633  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.29 
 
 
345 aa  96.3  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609317  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0291  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.77 
 
 
346 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0307  glycosyl transferase family 9  30.67 
 
 
374 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0586  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.77 
 
 
346 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2419  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.77 
 
 
346 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0665  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.29 
 
 
345 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0491  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.17 
 
 
354 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.22 
 
 
343 aa  95.5  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1009  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  30.16 
 
 
371 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1783  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 
335 aa  94.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>