289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4096 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4096  glycosyl transferase family 9  100 
 
 		 324 aa  668    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.190613  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3691  heptosyltransferase family protein  59.44 
 
 		 326 aa  425  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0262  glycosyl transferase family protein  59.44 
 
 		 326 aa  424  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3934  heptosyltransferase family protein  59.13 
 
 		 326 aa  421  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5654  glycosyl transferase family protein  51.69 
 
 		 381 aa  339  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2335  glycosyl transferase family protein  51.69 
 
 		 362 aa  335  5e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0499927 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1700  glycosyl transferase family protein  51.54 
 
 		 364 aa  332  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2312  glycosyl transferase family protein  51.54 
 
 		 364 aa  332  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2231  glycosyl transferase family protein  50.31 
 
 		 364 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2351  glycosyl transferase family protein  50.31 
 
 		 364 aa  325  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0162  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0371  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 378 aa  115  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4835  glycosyl transferase family protein  24.78 
 
 		 337 aa  93.6  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0140311  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1407  glycosyl transferase family protein  23.46 
 
 		 306 aa  86.7  5e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.191026  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  27.3 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  25.14 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4830  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.244067  hitchhiker  0.0000484932 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.27 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.58 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.27 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.27 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.29 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.27 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.29 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.29 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.29 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.73 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  23.66 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.59 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  23.75 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.38 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3149  glycosyl transferase family protein  25.25 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.29 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.24 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  24.22 
 
 		 347 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.52 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  22.67 
 
 		 344 aa  69.3  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0626  glycosyl transferase family protein  22.78 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0429094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  23.95 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  24.54 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.5 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.49 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.28 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  21.57 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  21.57 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3516  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.58 
 
 		 387 aa  65.9  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  22.4 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.4 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5670  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.92 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  22.79 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.91 
 
 		 332 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.4 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.91 
 
 		 332 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  22.87 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.91 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0852  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.3 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  22.87 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  22.87 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3033  glycosyl transferase family protein  26.02 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3647  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.3 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  22.6 
 
 		 393 aa  62.8  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  22.71 
 
 		 360 aa  62  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3562  glycosyl transferase family protein  24.24 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1060  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.59 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.845943 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  23.96 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.14 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  22.73 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3628  glycosyl transferase family 9  23.91 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  24.55 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.03 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  23.89 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0354  glycosyl transferase family 9  23.65 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  20.68 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.52 
 
 		 516 aa  59.7  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  22.7 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1707  glycosyl transferase family 9  23.1 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  22.25 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  21.93 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.98 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0386  glycosyl transferase family 9  21.1 
 
 		 350 aa  59.3  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.62 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3702  glycosyl transferase family 9  23.91 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0070  glycosyl transferase family protein  21.38 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  22.08 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1977  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase, putative  22.44 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1683  heptosyltransferase family protein  22.71 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3977  glycosyl transferase family protein  23.49 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1791  heptosyltransferase  21.96 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00189607 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  22.65 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  22.92 
 
 		 356 aa  57  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  22.71 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0282  glycosyl transferase family 9  23.92 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0851  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.75 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  19.66 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.9 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.46 
 
 		 361 aa  55.8  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  22.8 
 
 		 389 aa  55.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1968  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  22.44 
 
 		 388 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.78963  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2224  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.51 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112899  normal  0.0907149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>