155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0354 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0354  glycosyl transferase family 9  100 
 
 
345 aa  718    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0281  glycosyl transferase family 9  56.42 
 
 
348 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0386  glycosyl transferase family 9  51.81 
 
 
350 aa  363  3e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0360  glycosyl transferase family protein  50.74 
 
 
369 aa  358  6e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.987967  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1474  heptosyltransferase  45.93 
 
 
347 aa  330  2e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.379549  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1794  heptosyltransferase  42.35 
 
 
329 aa  262  6e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0140339 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1791  heptosyltransferase  39.88 
 
 
360 aa  245  9e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00189607 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3934  heptosyltransferase family protein  24.62 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3691  heptosyltransferase family protein  23.87 
 
 
326 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0262  glycosyl transferase family protein  23.87 
 
 
326 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  23.7 
 
 
394 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.7 
 
 
390 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.7 
 
 
390 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2252  heptosyltransferase family protein  26.4 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.548459  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  23.38 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  23.38 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  23.38 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  23.38 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  26.57 
 
 
349 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  26.22 
 
 
349 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  22.7 
 
 
348 aa  64.3  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  25.34 
 
 
361 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  24.82 
 
 
324 aa  63.2  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0307  glycosyl transferase family 9  23.26 
 
 
374 aa  62.8  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4835  glycosyl transferase family protein  22.94 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0140311  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  25.26 
 
 
360 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2260  glycosyl transferase family protein  23.76 
 
 
364 aa  60.8  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  24.82 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.05 
 
 
339 aa  60.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4096  glycosyl transferase family 9  23.65 
 
 
324 aa  60.1  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.190613  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.88 
 
 
357 aa  60.1  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.33 
 
 
360 aa  60.1  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  22.62 
 
 
458 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  21.93 
 
 
402 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  24.03 
 
 
409 aa  59.7  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  21.58 
 
 
392 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  25.85 
 
 
351 aa  59.7  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.79 
 
 
352 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.53 
 
 
352 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.53 
 
 
352 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.31 
 
 
356 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  21.99 
 
 
371 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  25.85 
 
 
351 aa  58.9  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.53 
 
 
352 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  21.89 
 
 
379 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  21.26 
 
 
392 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  21.26 
 
 
392 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  22.45 
 
 
357 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  21.26 
 
 
392 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  22.52 
 
 
335 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  21.88 
 
 
350 aa  57.4  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  22.68 
 
 
354 aa  57.4  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3033  glycosyl transferase family protein  22.41 
 
 
348 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  21.59 
 
 
475 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0607  glycosyl transferase family protein  21.84 
 
 
386 aa  56.6  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  22.78 
 
 
340 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.78 
 
 
340 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.78 
 
 
340 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2806  glycosyl transferase family protein  24.08 
 
 
362 aa  56.2  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.629835 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3025  heptosyltransferase family protein  21.9 
 
 
517 aa  56.2  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.49 
 
 
352 aa  56.2  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0162  glycosyl transferase family protein  22.29 
 
 
319 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1683  heptosyltransferase family protein  22.89 
 
 
339 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943397  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  21.78 
 
 
404 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.08 
 
 
516 aa  54.3  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1403  putative heptosyltransferase III waaq  22.49 
 
 
356 aa  53.1  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.308915  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.64 
 
 
360 aa  52.8  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.05 
 
 
356 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1248  glycosyl transferase family 9  23.03 
 
 
385 aa  52.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.9727 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3934  glycosyl transferase family protein  23.39 
 
 
343 aa  52  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157476  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2415  glycosyl transferase family 9  22.81 
 
 
326 aa  52.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0888849  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  21.97 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  21.79 
 
 
361 aa  51.6  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0371  glycosyl transferase family protein  21.38 
 
 
378 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  22.61 
 
 
367 aa  50.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  22.33 
 
 
334 aa  50.1  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  20.07 
 
 
344 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  20.77 
 
 
362 aa  50.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2822  hypothetical protein  26.15 
 
 
350 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.434066  normal  0.700436 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  24.5 
 
 
347 aa  49.7  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2827  glycosyl transferase family 9  21.73 
 
 
332 aa  49.7  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.31 
 
 
368 aa  49.3  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  23.86 
 
 
373 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2231  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 
364 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338321  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.29 
 
 
359 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2351  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 
364 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4076  putative glycosyl transferase  23.48 
 
 
394 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.303015  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  23.86 
 
 
356 aa  49.3  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0282  glycosyl transferase family 9  20.2 
 
 
350 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0093  heptosyltransferase  23.28 
 
 
335 aa  48.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.283951  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0338  lipooligosaccharide D-glycero-D-manno-heptosyltransferase  23.55 
 
 
320 aa  48.1  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.411882  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  23.43 
 
 
348 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  22.07 
 
 
344 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3479  glycosyl transferase family 9  20.96 
 
 
342 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0749  glycosyl transferase family protein  20.59 
 
 
331 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.481302  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2622  glycosyl transferase family 9  25.09 
 
 
327 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  20.81 
 
 
356 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1663  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  25.38 
 
 
350 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  normal  0.0406794 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1145  hypothetical protein  25.38 
 
 
350 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0327893  hitchhiker  0.0000000362353 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  20.95 
 
 
356 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>