More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2822 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2822  glycosyl transferase family 9  100 
 
 		 357 aa  732    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1722  glycosyl transferase family 9  39.89 
 
 		 350 aa  282  5.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3077  glycosyl transferase family 9  38.72 
 
 		 355 aa  249  6e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212218 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03000  heptosyltransferase  39.12 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0265488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1046  glycosyl transferase family protein  38.3 
 
 		 335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0069  glycosyl transferase family 9  37.54 
 
 		 345 aa  234  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.960845  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1155  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase, putative  38.1 
 
 		 296 aa  180  4e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.14 
 
 		 516 aa  128  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2622  glycosyl transferase family 9  29.91 
 
 		 327 aa  116  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  27.87 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.34 
 
 		 368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  29.08 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1515  glycosyl transferase family 9  25.36 
 
 		 315 aa  107  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  26.02 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0977  glycosyl transferase family 9  30.2 
 
 		 336 aa  104  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.412214  hitchhiker  0.000380468 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  22.69 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0093  heptosyltransferase  23.63 
 
 		 335 aa  99.8  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.283951  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1629  heptosyltransferase family protein  27.78 
 
 		 341 aa  99.4  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.77 
 
 		 360 aa  97.8  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2827  glycosyl transferase family 9  26.61 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  22.99 
 
 		 330 aa  97.4  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 		 344 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1212  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 		 351 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  26.17 
 
 		 344 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  27.69 
 
 		 354 aa  94.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2260  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 		 364 aa  94.4  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  23.45 
 
 		 344 aa  93.2  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 		 364 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.41 
 
 		 348 aa  90.9  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0145  glycosyl transferase family 9  24.79 
 
 		 334 aa  89.7  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0787699  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  24.58 
 
 		 335 aa  89.4  8e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0579  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.3 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0417722 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.56 
 
 		 339 aa  87.8  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.4 
 
 		 332 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.4 
 
 		 332 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  26.65 
 
 		 361 aa  87  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1683  heptosyltransferase family protein  24.12 
 
 		 339 aa  86.7  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0668  glycosyl transferase family 9  24.43 
 
 		 304 aa  86.3  8e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000239845  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  27.57 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  25.46 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1100  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  24.8 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000330109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II- LPS biosynthesis, waaF  28.7 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57864  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.46 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0160  glycosyl transferase family 9  23.53 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.081148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  23.76 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.84 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4862  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.3 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0366  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0341  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.3 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.455159  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0369  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.489126 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.73 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.99 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.32 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1870  heptosyltransferase family protein  26.99 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  25.89 
 
 		 779 aa  80.1  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1550  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.2 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001794  ADP-heptose--lipooligosaccharide heptosyltransferase II  25.41 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.578647  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  26.45 
 
 		 363 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5003  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.84 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.44 
 
 		 359 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  23.65 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  23.93 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0229  glycosyl transferase family 9  26.32 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  24.65 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3479  glycosyl transferase family 9  24 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.31 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00459  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  22.53 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.65 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0615  glycosyl transferase family 9  26.75 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0520  glycosyl transferase family protein  26.41 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5747  heptosyltransferase II  24.36 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66250  heptosyltransferase II  25.23 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0801  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.42 
 
 		 335 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1756  glycosyl transferase family 9  26.95 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0677074  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0454  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.7 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  0.709845 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.61 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  23.91 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  23.91 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0465  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.12 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  27.59 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2806  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629835 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3934  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157476  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  23.76 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  25.14 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  25.15 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0262  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  25.56 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0161  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  25.56 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.45 
 
 		 337 aa  72.8  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0334  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.79 
 
 		 343 aa  72  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  25.58 
 
 		 347 aa  72  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0016  glycosyl transferase family protein  24.41 
 
 		 357 aa  72.4  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  22.31 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0307  glycosyl transferase family 9  25.41 
 
 		 374 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  23.01 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  26.12 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1612  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.3 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>