282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1722 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1722  glycosyl transferase family 9  100 
 
 		 350 aa  724    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3077  glycosyl transferase family 9  46.29 
 
 		 355 aa  292  5e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2822  glycosyl transferase family 9  39.89 
 
 		 357 aa  282  5.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1046  glycosyl transferase family protein  42.82 
 
 		 335 aa  278  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03000  heptosyltransferase  44.64 
 
 		 331 aa  276  4e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0265488  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0069  glycosyl transferase family 9  38.05 
 
 		 345 aa  222  9e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.960845  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1155  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase, putative  40.07 
 
 		 296 aa  197  3e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1515  glycosyl transferase family 9  26.25 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  25.87 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  25.53 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 		 333 aa  101  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1629  heptosyltransferase family protein  25.36 
 
 		 341 aa  99.8  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  23.6 
 
 		 335 aa  96.3  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  23.05 
 
 		 324 aa  94.4  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0801  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.69 
 
 		 335 aa  93.6  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.22 
 
 		 343 aa  92.8  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1212  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 351 aa  89.7  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0145  glycosyl transferase family 9  24.43 
 
 		 334 aa  89.7  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0787699  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  25 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  24.86 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  23.6 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.1 
 
 		 516 aa  84.3  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0093  heptosyltransferase  23.14 
 
 		 335 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.283951  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0160  glycosyl transferase family 9  24.1 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.081148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.01 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.71 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  24.43 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1100  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  20.92 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000330109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2622  glycosyl transferase family 9  24.01 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  24.65 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  24.67 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2827  glycosyl transferase family 9  23.33 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  24.67 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 		 344 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.73 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.73 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.83 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0977  glycosyl transferase family 9  23.96 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.412214  hitchhiker  0.000380468 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  25.37 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.56 
 
 		 332 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.45 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1067  glycosyl transferase family 9  25.43 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000716573  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00459  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  21.15 
 
 		 359 aa  72  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0615  glycosyl transferase family 9  25.51 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.91 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1683  heptosyltransferase family protein  23.78 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.22 
 
 		 359 aa  67  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  23.08 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  23.27 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3479  glycosyl transferase family 9  20.91 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  24.72 
 
 		 779 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2523  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 		 549 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0027494  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  23.51 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  34.96 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2764  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  23.3 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1228  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.34 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3136  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.66 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5746  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887327  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  22.99 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2239  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 		 431 aa  63.5  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  24.36 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0668  glycosyl transferase family 9  30.77 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000239845  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  22.42 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0393  glycosyl transferase family protein  20.16 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.326109  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.45 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2806  glycosyl transferase family protein  21.85 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66240  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.45 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.45 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.45 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.32 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  22.73 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.45 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3011  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169965  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.83 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.1 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0307  glycosyl transferase family 9  19.8 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  22.03 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.11 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.08 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0159  glycosyl transferase family protein  24.66 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0473  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.93 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.189899  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0510  glycosyl transferase family 9  24.26 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4371  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  22.22 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1870  heptosyltransferase family protein  23.93 
 
 		 352 aa  57  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.26 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.08 
 
 		 356 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.08 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.08 
 
 		 356 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  23.56 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  23.89 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0520  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5003  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.54 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1516  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.9 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.74 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1150  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.16 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.16673  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  23.1 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2581  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.99 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0315509  normal  0.0579279 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II- LPS biosynthesis, waaF  26.4 
 
 		 349 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57864  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.12 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>