271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3077 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3077  glycosyl transferase family 9  100 
 
 
355 aa  737    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1722  glycosyl transferase family 9  46.29 
 
 
350 aa  292  5e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1046  glycosyl transferase family protein  46.61 
 
 
335 aa  291  8e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2822  glycosyl transferase family 9  38.72 
 
 
357 aa  249  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03000  heptosyltransferase  41.18 
 
 
331 aa  239  5e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0265488  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0069  glycosyl transferase family 9  40.25 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.960845  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1155  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase, putative  36.27 
 
 
296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  24.77 
 
 
329 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2622  glycosyl transferase family 9  25.67 
 
 
327 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  23.94 
 
 
324 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  26.2 
 
 
333 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0160  glycosyl transferase family 9  27.73 
 
 
345 aa  99.4  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.081148  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  25.49 
 
 
330 aa  97.1  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1515  glycosyl transferase family 9  27.68 
 
 
315 aa  95.9  8e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1629  heptosyltransferase family protein  26.06 
 
 
341 aa  96.3  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.69 
 
 
516 aa  95.1  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  23.65 
 
 
332 aa  91.3  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  23.45 
 
 
335 aa  90.1  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  24.71 
 
 
334 aa  89  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  24.93 
 
 
344 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0145  glycosyl transferase family 9  26.35 
 
 
334 aa  87  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0787699  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  25.5 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2827  glycosyl transferase family 9  21.74 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  26.07 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  23.16 
 
 
330 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0615  glycosyl transferase family 9  23.48 
 
 
388 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3479  glycosyl transferase family 9  24.1 
 
 
342 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.13 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1212  glycosyl transferase family protein  24.18 
 
 
351 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.65 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.65 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0977  glycosyl transferase family 9  24.13 
 
 
336 aa  72.4  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.412214  hitchhiker  0.000380468 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.73 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.83 
 
 
356 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  20.27 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  20.27 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.1 
 
 
361 aa  71.2  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.75 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.5 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.5 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.5 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  23.5 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3136  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.86 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.01 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.46 
 
 
359 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0307  glycosyl transferase family 9  24.05 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0668  glycosyl transferase family 9  23.19 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000239845  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001794  ADP-heptose--lipooligosaccharide heptosyltransferase II  22.78 
 
 
352 aa  66.2  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.578647  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2806  glycosyl transferase family protein  24.67 
 
 
362 aa  66.2  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.629835 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0093  heptosyltransferase  23.05 
 
 
335 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.283951  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2616  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.16 
 
 
346 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2581  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.43 
 
 
332 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0315509  normal  0.0579279 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3033  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 
348 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0262  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  23.48 
 
 
356 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0161  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  23.48 
 
 
356 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.12 
 
 
343 aa  64.7  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0070  glycosyl transferase family protein  20.75 
 
 
347 aa  64.7  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.64 
 
 
352 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.64 
 
 
352 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.64 
 
 
352 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.26 
 
 
352 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0334  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.18 
 
 
343 aa  64.3  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0520  glycosyl transferase family protein  24.44 
 
 
344 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0337  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.12 
 
 
343 aa  63.9  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  22.83 
 
 
349 aa  62.8  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  21.26 
 
 
367 aa  62.8  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  21.77 
 
 
347 aa  62.8  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.33 
 
 
356 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.3 
 
 
360 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.3 
 
 
352 aa  62.4  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0369  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.23 
 
 
349 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.489126 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0341  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.96 
 
 
349 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.455159  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5003  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.73 
 
 
344 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.92 
 
 
357 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  21.77 
 
 
354 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.29 
 
 
359 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1100  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  19.22 
 
 
353 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000330109  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0393  glycosyl transferase family protein  21.37 
 
 
385 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.326109  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0366  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.96 
 
 
349 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23 
 
 
356 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  21.43 
 
 
347 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.92 
 
 
368 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4862  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.23 
 
 
349 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4336  glycosyl transferase family protein  21.09 
 
 
347 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  20.8 
 
 
343 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.99 
 
 
361 aa  60.1  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  22.38 
 
 
340 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.38 
 
 
340 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1683  heptosyltransferase family protein  23.03 
 
 
339 aa  59.7  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943397  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  21.32 
 
 
369 aa  59.7  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.38 
 
 
340 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  21.65 
 
 
348 aa  59.3  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1535  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.11 
 
 
346 aa  59.3  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  23.08 
 
 
348 aa  59.3  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.4 
 
 
353 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  19.93 
 
 
350 aa  59.3  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  23.47 
 
 
351 aa  58.5  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  20.98 
 
 
348 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1164  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.13 
 
 
317 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  23.47 
 
 
351 aa  58.5  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>