More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1228 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1228  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  100 
 
 
324 aa  660    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0470  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  71.6 
 
 
324 aa  489  1e-137  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0284268  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1399  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  54.21 
 
 
322 aa  337  9.999999999999999e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.348076  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1247  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  45.1 
 
 
339 aa  262  4.999999999999999e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.313368  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1150  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  43.53 
 
 
342 aa  253  3e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.16673  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1275  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  43.53 
 
 
342 aa  251  1e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.336205  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0588  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  43.24 
 
 
342 aa  251  1e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0589  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  39.02 
 
 
326 aa  195  7e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253987  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1808  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  38.11 
 
 
327 aa  192  6e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0801  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  34.22 
 
 
335 aa  170  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5746  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.46 
 
 
355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887327  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66240  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.89 
 
 
354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0580  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.49 
 
 
334 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0447499 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4827  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  27.66 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.000206401 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0521  glycosyl transferase family protein  26.26 
 
 
354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.99 
 
 
352 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0466  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.72 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5002  lipopolysaccharide heptosyltransferase  26.26 
 
 
354 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26 
 
 
352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.381359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0342  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.33 
 
 
352 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0367  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.33 
 
 
352 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4994  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  26.5 
 
 
330 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4090  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  25.8 
 
 
320 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44850  lipopolysaccharide heptosyltransferase I, waaC  23.24 
 
 
354 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.721697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4124  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  26.5 
 
 
323 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815004  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3928  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.87 
 
 
317 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0088  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  26.5 
 
 
323 aa  107  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0341266  normal  0.158006 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3832  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  26.5 
 
 
323 aa  107  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000019224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0084  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.5 
 
 
319 aa  106  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00990907  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4371  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  25.44 
 
 
327 aa  106  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03478  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  26.5 
 
 
326 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3948  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  25.8 
 
 
323 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3958  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  26.15 
 
 
323 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0259947  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4048  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  26.5 
 
 
326 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000904915  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  25.9 
 
 
350 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3771  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.24 
 
 
335 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03429  hypothetical protein  26.5 
 
 
300 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0753  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.62 
 
 
324 aa  103  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.171103 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2998  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.57 
 
 
353 aa  103  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1610  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.16 
 
 
314 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.812323  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0115  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  25.89 
 
 
328 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0171  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  25.62 
 
 
322 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.425143  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1640  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.81 
 
 
360 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.45347 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.47 
 
 
362 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.19 
 
 
353 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3404  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.31 
 
 
351 aa  100  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1611  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  24.2 
 
 
321 aa  99.8  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1428  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.18 
 
 
327 aa  99.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4148  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  26.15 
 
 
321 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0068  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  26.15 
 
 
321 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0062  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  26.15 
 
 
321 aa  98.6  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0223597  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0257  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.3 
 
 
342 aa  98.2  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.36453  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3992  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  25.53 
 
 
317 aa  96.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4512  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.52 
 
 
314 aa  95.9  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.935025  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0411  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.58 
 
 
350 aa  95.9  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209214  hitchhiker  0.00110647 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0235  lipopolysaccharide heptosyltransferase 1  24.58 
 
 
350 aa  95.9  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1550  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.68 
 
 
357 aa  95.9  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4037  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  25.53 
 
 
317 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1109  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.36 
 
 
374 aa  95.1  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.316651  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3911  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  25.53 
 
 
317 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0446452 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1598  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.37 
 
 
314 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3930  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  25.18 
 
 
317 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2331  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.6 
 
 
366 aa  94  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000713254  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4098  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  25.18 
 
 
317 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  26.33 
 
 
779 aa  94.4  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0661  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.56 
 
 
336 aa  92.4  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.796134 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3214  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.78 
 
 
346 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0642  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.52 
 
 
332 aa  90.1  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1060  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.91 
 
 
334 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.845943 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1294  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.37 
 
 
314 aa  90.1  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2224  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.02 
 
 
340 aa  90.1  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112899  normal  0.0907149 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0281  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.86 
 
 
352 aa  89  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.93835  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3421  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase-1  24.92 
 
 
334 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.17 
 
 
332 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288239  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1066  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.1 
 
 
314 aa  87  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0601  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.87 
 
 
332 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100938  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2242  heptosyltransferase family protein  22.62 
 
 
355 aa  85.9  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0949  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.79 
 
 
332 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  25.08 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4092  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.4 
 
 
340 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102262  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2764  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  24.85 
 
 
348 aa  84.3  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.83 
 
 
332 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.727875  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1516  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.5 
 
 
347 aa  84  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1490  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.94 
 
 
355 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863183  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1100  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  26.45 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000330109  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0968  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.62 
 
 
309 aa  84  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3141  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.95 
 
 
355 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0415  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.04 
 
 
357 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0894  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.04 
 
 
357 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133252  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3118  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.95 
 
 
355 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.145361  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0864  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.04 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3082  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.95 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2266  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.28 
 
 
380 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.370229  normal  0.206331 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0692  lipopolysaccharide heptosyltransferase protein  24.28 
 
 
332 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00185807  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.85 
 
 
357 aa  82  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0510  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.79 
 
 
332 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0989  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.79 
 
 
332 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0259349  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0851  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.7 
 
 
346 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  25.87 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2551  heptosyltransferase I  25.63 
 
 
355 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>