294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1399 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1399  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  100 
 
 
322 aa  640    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.348076  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1228  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  54.21 
 
 
324 aa  337  9.999999999999999e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0470  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  54.83 
 
 
324 aa  336  2.9999999999999997e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0284268  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0588  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  47.8 
 
 
342 aa  273  3e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1275  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  47.8 
 
 
342 aa  273  3e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.336205  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1150  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  47.51 
 
 
342 aa  270  2e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.16673  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1247  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  45.56 
 
 
339 aa  257  2e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.313368  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0589  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  38.62 
 
 
326 aa  193  3e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253987  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1808  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  36.36 
 
 
327 aa  188  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0801  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  35.54 
 
 
335 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0580  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.02 
 
 
334 aa  119  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0447499 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4371  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  25 
 
 
327 aa  116  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4827  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  27.84 
 
 
323 aa  115  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.000206401 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2331  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.51 
 
 
366 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000713254  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3948  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  26.2 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66240  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.56 
 
 
354 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4090  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  24.63 
 
 
320 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5746  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.78 
 
 
355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887327  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1611  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  26.22 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4512  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.15 
 
 
314 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.935025  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0235  lipopolysaccharide heptosyltransferase 1  26.28 
 
 
350 aa  109  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0411  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.28 
 
 
350 aa  109  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209214  hitchhiker  0.00110647 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5002  lipopolysaccharide heptosyltransferase  26.19 
 
 
354 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1066  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.42 
 
 
314 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3214  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.07 
 
 
346 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4037  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  25.99 
 
 
317 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0521  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 
354 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0466  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.1 
 
 
353 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3992  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  26.5 
 
 
317 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4148  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  27.44 
 
 
321 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0068  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  27.44 
 
 
321 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1294  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.47 
 
 
314 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0062  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  27.44 
 
 
321 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0223597  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44850  lipopolysaccharide heptosyltransferase I, waaC  22.13 
 
 
354 aa  106  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.721697  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3771  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.08 
 
 
335 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1610  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.33 
 
 
314 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.812323  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4098  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  25.87 
 
 
317 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3911  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  25.08 
 
 
317 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0446452 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1428  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.2 
 
 
327 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3930  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  25.38 
 
 
317 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03478  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  25.57 
 
 
326 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03429  hypothetical protein  25.57 
 
 
300 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2715  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.85 
 
 
363 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.902664  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0171  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  25.48 
 
 
322 aa  102  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.425143  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1598  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.74 
 
 
314 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3404  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.51 
 
 
351 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0084  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.57 
 
 
319 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00990907  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.13 
 
 
352 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.381359 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3832  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  25.57 
 
 
323 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000019224  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0088  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  25.57 
 
 
323 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0341266  normal  0.158006 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3958  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  25.57 
 
 
323 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0259947  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  23.68 
 
 
350 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4994  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  26.04 
 
 
330 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4048  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  25.57 
 
 
326 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000904915  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4124  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  25.57 
 
 
323 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815004  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0115  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  26.8 
 
 
328 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0851  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.28 
 
 
346 aa  99.4  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0342  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.2 
 
 
352 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0367  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.2 
 
 
352 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0692  lipopolysaccharide heptosyltransferase protein  24.44 
 
 
332 aa  98.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00185807  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.21 
 
 
353 aa  98.2  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0968  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.91 
 
 
309 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.75 
 
 
352 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0921  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.6 
 
 
333 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2242  heptosyltransferase family protein  25.22 
 
 
355 aa  96.3  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3700  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase-1  26.6 
 
 
333 aa  96.3  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0642  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.08 
 
 
332 aa  95.9  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0601  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.08 
 
 
332 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100938  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2266  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.02 
 
 
380 aa  94  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.370229  normal  0.206331 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3928  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.89 
 
 
317 aa  94  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1109  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.02 
 
 
374 aa  93.6  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.316651  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0753  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.44 
 
 
324 aa  93.6  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.171103 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1490  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.16 
 
 
355 aa  93.2  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863183  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1060  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.31 
 
 
334 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.845943 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0257  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.38 
 
 
342 aa  92  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.36453  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0281  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.18 
 
 
352 aa  92  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.93835  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3421  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase-1  24.38 
 
 
334 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0661  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.4 
 
 
336 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.796134 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1550  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.12 
 
 
357 aa  90.1  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1516  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.86 
 
 
347 aa  89.7  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3141  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.36 
 
 
355 aa  89.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3118  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.36 
 
 
355 aa  89.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.145361  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3082  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.36 
 
 
331 aa  89.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2551  heptosyltransferase I  24.36 
 
 
355 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0717  heptosyltransferase I  24.36 
 
 
355 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.35 
 
 
362 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2190  heptosyltransferase I  24.36 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.362399  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2063  heptosyltransferase I  24.36 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184643  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2496  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25 
 
 
357 aa  86.3  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4000  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.2 
 
 
342 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0864  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.12 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4092  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.03 
 
 
340 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102262  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0415  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.04 
 
 
357 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0510  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.58 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0894  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.04 
 
 
357 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133252  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0989  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.58 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0259349  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0949  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.23 
 
 
332 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0784  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.96 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.71 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288239  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00459  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  25.9 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>