More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2764 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2764  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  100 
 
 
348 aa  685    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  47.81 
 
 
349 aa  281  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3033  glycosyl transferase family protein  47.11 
 
 
348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00459  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  39.14 
 
 
359 aa  269  7e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1100  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  35.36 
 
 
353 aa  213  4.9999999999999996e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000330109  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  34 
 
 
779 aa  173  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  33.99 
 
 
364 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  35.39 
 
 
350 aa  138  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.44 
 
 
360 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  32.21 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.77 
 
 
337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.01 
 
 
368 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.82 
 
 
341 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.53 
 
 
341 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.75 
 
 
343 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0491  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.09 
 
 
354 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1490  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  34.21 
 
 
355 aa  116  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863183  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.66 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2331  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.7 
 
 
366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000713254  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.61 
 
 
348 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0521  glycosyl transferase family protein  32.01 
 
 
354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0545  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.9 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0086605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.78 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288239  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2496  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.55 
 
 
357 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3214  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.78 
 
 
346 aa  110  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0851  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.17 
 
 
346 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44850  lipopolysaccharide heptosyltransferase I, waaC  34.01 
 
 
354 aa  109  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.721697  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5002  lipopolysaccharide heptosyltransferase  32.75 
 
 
354 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3928  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.33 
 
 
317 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3082  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.66 
 
 
331 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2190  heptosyltransferase I  33.66 
 
 
331 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.362399  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2063  heptosyltransferase I  33.66 
 
 
331 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184643  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.2 
 
 
346 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2266  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.33 
 
 
380 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.370229  normal  0.206331 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0804  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.44 
 
 
340 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.575545  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2108  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.44 
 
 
340 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1976  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.44 
 
 
340 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2636  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.44 
 
 
340 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.11 
 
 
332 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.727875  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.55 
 
 
343 aa  107  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.1 
 
 
339 aa  106  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3118  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.33 
 
 
355 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.145361  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2551  heptosyltransferase I  33.33 
 
 
355 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3141  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.33 
 
 
355 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0717  heptosyltransferase I  33.33 
 
 
355 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3061  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.78 
 
 
340 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3028  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.78 
 
 
340 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2963  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.78 
 
 
340 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 
401 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.55 
 
 
341 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 
401 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0454  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.55 
 
 
341 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  0.709845 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  32.51 
 
 
401 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0789  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.53 
 
 
335 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  30.75 
 
 
392 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1228  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.69 
 
 
324 aa  104  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.11 
 
 
415 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
392 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
392 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4092  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.79 
 
 
340 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102262  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3771  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.36 
 
 
335 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3404  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.32 
 
 
351 aa  103  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1428  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.23 
 
 
327 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0753  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.29 
 
 
324 aa  103  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.171103 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2792  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.57 
 
 
362 aa  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0445733  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0171  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  31.13 
 
 
322 aa  103  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.425143  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.93 
 
 
353 aa  102  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  29.29 
 
 
390 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  25.58 
 
 
354 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 
404 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0832  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.75 
 
 
346 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0990  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.75 
 
 
346 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.58 
 
 
362 aa  102  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3700  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase-1  32.69 
 
 
333 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4100  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 
340 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4512  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.64 
 
 
314 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.935025  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  32.05 
 
 
405 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.87 
 
 
359 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0466  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.35 
 
 
353 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  25.91 
 
 
347 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0784  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.66 
 
 
331 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
347 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 
340 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  29.64 
 
 
475 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
359 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  26.82 
 
 
347 aa  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0949  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.46 
 
 
332 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
347 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.22 
 
 
359 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  29.26 
 
 
341 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
402 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  26.28 
 
 
336 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0989  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.46 
 
 
332 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0259349  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.28 
 
 
352 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.381359 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0510  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.46 
 
 
332 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0773  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.66 
 
 
331 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263429  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66240  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  32.92 
 
 
354 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2242  heptosyltransferase family protein  30.11 
 
 
355 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4827  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  30.03 
 
 
323 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.000206401 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5746  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.13 
 
 
355 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>