More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3808 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3808  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 444 aa  917    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.75 
 
 		 359 aa  94.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  23.92 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.27 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1654  glycosyl transferase family 9  29.41 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3950  glycosyl transferase family protein  23.09 
 
 		 778 aa  75.1  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75941 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  38.24 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3025  heptosyltransferase family protein  22.22 
 
 		 517 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  24.33 
 
 		 323 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  24.74 
 
 		 348 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0315  glycosyl transferase family 9  27.75 
 
 		 343 aa  69.7  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.62 
 
 		 516 aa  68.9  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.29 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3550  putative adp-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  31.49 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  26.33 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 		 361 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.31 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  24.51 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  33.74 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2239  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  28.24 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1870  heptosyltransferase family protein  29.34 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.5 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.5 
 
 		 356 aa  67  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 		 367 aa  67  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.37 
 
 		 356 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.6 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 		 401 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  24.93 
 
 		 379 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  25 
 
 		 367 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.71 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.18 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  24.38 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.86 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.18 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.18 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.84 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0582  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.98 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000000638797  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0149  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.05 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.02 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  23.36 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0879  glycosyl transferase family 9  30.41 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000737815  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  29.86 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.53 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  26.47 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6399  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.0454867 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  31.07 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0359  glycosyl transferase family protein  36.52 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0479  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.66 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.11 
 
 		 368 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0578  glycosyl transferase family protein  36.72 
 
 		 302 aa  63.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  25.82 
 
 		 357 aa  62.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  23.68 
 
 		 329 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.87 
 
 		 356 aa  62  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0161  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  28.22 
 
 		 356 aa  62  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0262  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  28.22 
 
 		 356 aa  62  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0585  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1707  glycosyl transferase family 9  31.48 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0205  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.09 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1989  heptosyltransferase family protein  29.8 
 
 		 625 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1388  heptosyltransferase family protein  29.8 
 
 		 643 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356236  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0851  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.03 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  32.19 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3041  heptosyltransferase family protein  29.8 
 
 		 622 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3170  heptosyltransferase family protein  30.43 
 
 		 622 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2276  heptosyltransferase family protein  29.8 
 
 		 622 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1012  heptosyltransferase family protein  29.8 
 
 		 628 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1300  heptosyltransferase family protein  29.8 
 
 		 625 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3167  putative heptosyltransferase  29.59 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1986  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.59 
 
 		 338 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2273  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.59 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0964194  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1385  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.59 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  24.87 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1297  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.59 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161852  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3038  putative heptosyltransferase  29.59 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  28.75 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.19 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  24.43 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  27.59 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  33.09 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  30.6 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  30.6 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0508  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.75 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.104736  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4359  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114677  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2242  heptosyltransferase family protein  28.92 
 
 		 355 aa  57  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 		 318 aa  57  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30 
 
 		 343 aa  56.2  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0337  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  30 
 
 		 343 aa  56.2  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  27.46 
 
 		 349 aa  56.6  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 		 382 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2792  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.95 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0445733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0454  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.16 
 
 		 341 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  0.709845 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.06 
 
 		 352 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0668  glycosyl transferase family 9  34.69 
 
 		 304 aa  55.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000239845  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0589  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.62 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>