More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3809 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  100 
 
 		 381 aa  754    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  100 
 
 		 381 aa  754    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  52.94 
 
 		 379 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  52.35 
 
 		 358 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  51.88 
 
 		 358 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  51.64 
 
 		 358 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  55.09 
 
 		 390 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3038  putative heptosyltransferase  51.49 
 
 		 371 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3167  putative heptosyltransferase  51.49 
 
 		 371 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1385  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  51.49 
 
 		 371 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2273  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  51.19 
 
 		 371 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0964194  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1297  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  51.19 
 
 		 371 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161852  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1381  glycosyl transferase family protein  51.6 
 
 		 362 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6448  glycosyl transferase family protein  51.6 
 
 		 362 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6040  glycosyl transferase family protein  51.79 
 
 		 362 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.511032  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1009  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  50.89 
 
 		 371 aa  305  7e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1986  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  49.54 
 
 		 338 aa  288  8e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5589  glycosyl transferase family 9  43 
 
 		 334 aa  245  9e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3111  glycosyl transferase family 9  43.22 
 
 		 356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0738  putative LPS biosynthesis related glycosyltransferase  47.54 
 
 		 347 aa  232  8.000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5041  glycosyl transferase family 9  40.59 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.330457  normal  0.05523 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  43.65 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1783  glycosyl transferase family protein  42.55 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5534  glycosyl transferase family protein  46.18 
 
 		 369 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.11539 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  43.6 
 
 		 362 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4392  glycosyl transferase family protein  42.35 
 
 		 359 aa  196  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.747454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  37.18 
 
 		 352 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  35.46 
 
 		 368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3977  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 		 376 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  30.57 
 
 		 348 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  32.42 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.71 
 
 		 359 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  33.05 
 
 		 343 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  32.13 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.62 
 
 		 359 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  30.56 
 
 		 361 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1752  glycosyl transferase family protein  34.2 
 
 		 317 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5532  glycosyl transferase family protein  35.24 
 
 		 359 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223974 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0359  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  28.9 
 
 		 348 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0737  glycosyl transferase ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  35.69 
 
 		 370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.699457  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  28.82 
 
 		 356 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  27.07 
 
 		 779 aa  106  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  27.05 
 
 		 367 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.61 
 
 		 382 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1781  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 380 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  32.4 
 
 		 334 aa  103  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1766  glycosyl transferase family protein  31.29 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.45 
 
 		 360 aa  100  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.12 
 
 		 368 aa  99.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1567  glycosyl transferase family 9  33.78 
 
 		 358 aa  99.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.029243 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0710  glycosyl transferase family protein  34.39 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0566635  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  28.33 
 
 		 354 aa  97.4  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  34.11 
 
 		 330 aa  97.8  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 369 aa  95.9  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  23.89 
 
 		 330 aa  95.5  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.19 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.57 
 
 		 339 aa  94  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.68 
 
 		 361 aa  92.8  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 		 405 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.4 
 
 		 516 aa  90.9  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 		 347 aa  90.1  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0454  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.45 
 
 		 341 aa  90.1  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  0.709845 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  29.36 
 
 		 352 aa  89.7  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  28.74 
 
 		 344 aa  89.4  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.58 
 
 		 367 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.32 
 
 		 352 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  23.33 
 
 		 344 aa  88.6  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.98 
 
 		 299 aa  88.6  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3478  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.45 
 
 		 334 aa  87  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.18 
 
 		 337 aa  87  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.59 
 
 		 341 aa  87  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  27.59 
 
 		 341 aa  87  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 		 361 aa  87  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2461  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  43.79 
 
 		 410 aa  87  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 		 400 aa  86.7  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  23.7 
 
 		 356 aa  86.7  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  30.18 
 
 		 357 aa  86.3  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  25.27 
 
 		 406 aa  86.3  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  23.7 
 
 		 373 aa  86.3  9e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.59 
 
 		 346 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  38.61 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.12 
 
 		 362 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0366  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.21 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.07 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6399  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.0454867 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.56 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 		 379 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  26.88 
 
 		 364 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  29.4 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  29.4 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0341  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.92 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.455159  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  29.4 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0658  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  35.87 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0369  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.92 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.489126 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0582  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.45 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000000638797  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0351  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>