More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0578 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0578  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 302 aa  615  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4359  glycosyl transferase family protein  35.27 
 
 		 381 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2230  glycosyl transferase family protein  37.02 
 
 		 330 aa  132  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0384133  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3100  glycosyl transferase family 9  37.42 
 
 		 324 aa  129  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.649463 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0813  glycosyl transferase family protein  34.89 
 
 		 318 aa  125  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278172 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0263  glycosyl transferase family protein  38.63 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143955  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0749  glycosyl transferase family protein  35.54 
 
 		 331 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.481302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 		 361 aa  113  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  29.93 
 
 		 360 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.47 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  30.21 
 
 		 357 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.8 
 
 		 516 aa  101  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.29 
 
 		 339 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.86 
 
 		 348 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.67 
 
 		 368 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  29.31 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  23.37 
 
 		 330 aa  99.4  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.57 
 
 		 361 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.58 
 
 		 360 aa  97.4  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1707  glycosyl transferase family 9  31.64 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  29.1 
 
 		 356 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  29.1 
 
 		 356 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  29.1 
 
 		 356 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  29.1 
 
 		 356 aa  92.8  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 		 409 aa  92.4  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.93 
 
 		 353 aa  92.4  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.58 
 
 		 389 aa  92  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.76 
 
 		 356 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0229  glycosyl transferase family 9  26.9 
 
 		 348 aa  89.7  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.01 
 
 		 360 aa  89.4  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  26.56 
 
 		 351 aa  87.4  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.58 
 
 		 359 aa  87  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  26.56 
 
 		 351 aa  87.4  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1164  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.19 
 
 		 317 aa  87  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.73 
 
 		 361 aa  86.7  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1283  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.35 
 
 		 316 aa  86.7  5e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0326362  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.24 
 
 		 356 aa  86.3  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0580  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.72 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.604166  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.92 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0491  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.55 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1683  heptosyltransferase family protein  24.3 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.6 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.51 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.97 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  28.32 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.64 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.91 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.56 
 
 		 352 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.64 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  24.92 
 
 		 367 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.64 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4835  glycosyl transferase family protein  22.82 
 
 		 337 aa  82.4  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0140311  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3479  glycosyl transferase family 9  26.83 
 
 		 342 aa  82.4  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  27.3 
 
 		 332 aa  82.4  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0473  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.67 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.189899  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  28.01 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  26.58 
 
 		 352 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1870  heptosyltransferase family protein  27.4 
 
 		 352 aa  81.6  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.16 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  27.53 
 
 		 379 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  28.67 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.74 
 
 		 352 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  24.29 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3149  glycosyl transferase family protein  23.47 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.47 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2661  glycosyl transferase family 9  25.08 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141025 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  28.06 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  28.81 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.57 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  31.76 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2725  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.756386  normal  0.0898734 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3647  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27 
 
 		 397 aa  79.3  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3111  glycosyl transferase family 9  26.32 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.08 
 
 		 356 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 		 402 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0162  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 		 319 aa  79  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  26.14 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  27.15 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3215  glycosyl transferase family 9  28.52 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.573457  normal  0.197224 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0852  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.76 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  27.3 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  25.77 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.28 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.28 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  26.28 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  25.49 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 		 475 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5589  glycosyl transferase family 9  22.87 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3516  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.33 
 
 		 387 aa  76.3  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.55 
 
 		 357 aa  76.3  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.64 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03000  heptosyltransferase  25.68 
 
 		 331 aa  75.9  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0265488  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.07 
 
 		 367 aa  75.5  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>