More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3100 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3100  glycosyl transferase family 9  100 
 
 
324 aa  626  1e-178  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.649463 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0263  glycosyl transferase family protein  57 
 
 
298 aa  271  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143955  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2230  glycosyl transferase family protein  52.59 
 
 
330 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0384133  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0813  glycosyl transferase family protein  44.8 
 
 
318 aa  216  5e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278172 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0749  glycosyl transferase family protein  41.72 
 
 
331 aa  205  8e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.481302  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4359  glycosyl transferase family protein  39.75 
 
 
381 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114677  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0578  glycosyl transferase family protein  37.1 
 
 
302 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.97 
 
 
360 aa  89.4  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.22 
 
 
332 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.22 
 
 
332 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.17 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.68 
 
 
348 aa  82  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.94 
 
 
353 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.58 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0070  glycosyl transferase family protein  25.27 
 
 
347 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  25.42 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1283  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.69 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0326362  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  37.59 
 
 
367 aa  77.4  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.84 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.9 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0580  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.04 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.604166  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.07 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
347 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3025  heptosyltransferase family protein  26.33 
 
 
517 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  25.62 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  28.12 
 
 
337 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 
347 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  24.56 
 
 
354 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0576  heptosyltransferase  28.8 
 
 
418 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0669  heptosyltransferase  28.48 
 
 
418 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.822838  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1967  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  28.57 
 
 
418 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.85 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.33 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  24.2 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.97 
 
 
389 aa  69.7  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1164  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  22.3 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3947  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  27.54 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4336  glycosyl transferase family protein  23.84 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4100  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240394 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
404 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1978  lipopolysaccharide heptosyltransferase II rfaC2  26.91 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.27 
 
 
341 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  24.56 
 
 
340 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0852  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  32.62 
 
 
387 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1870  heptosyltransferase family protein  27.81 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0473  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  21.77 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.189899  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.12 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0111  glycosyl transferase family protein  24.2 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3647  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  32.62 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0109  glycosyl transferase family protein  23.13 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.75 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  23.84 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0172  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  26.48 
 
 
350 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.063279  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0479  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.5 
 
 
317 aa  67  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0069  glycosyl transferase family 9  23.02 
 
 
345 aa  67  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.960845  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  24.14 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  27.14 
 
 
356 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  34.72 
 
 
364 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.3 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3910  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.63 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0446452 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  30.41 
 
 
354 aa  65.9  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4036  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.63 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3929  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.63 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1707  glycosyl transferase family 9  29.39 
 
 
322 aa  65.9  0.0000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3516  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  32.37 
 
 
387 aa  65.9  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.25 
 
 
361 aa  65.9  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0149  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29 
 
 
341 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2581  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.36 
 
 
332 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0315509  normal  0.0579279 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3991  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.63 
 
 
348 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0205  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.97 
 
 
331 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  27.59 
 
 
332 aa  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1046  glycosyl transferase family protein  20.58 
 
 
335 aa  65.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4826  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  26.4 
 
 
348 aa  65.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290967  hitchhiker  0.000199841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.01 
 
 
350 aa  65.1  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1403  putative heptosyltransferase III waaq  22.8 
 
 
356 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.308915  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  28.67 
 
 
334 aa  64.3  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2252  heptosyltransferase family protein  25.49 
 
 
370 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.548459  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03000  heptosyltransferase  20.94 
 
 
331 aa  65.1  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0265488  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  25.83 
 
 
394 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4097  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.32 
 
 
348 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0009  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.39 
 
 
349 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  37.04 
 
 
333 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.37 
 
 
359 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0116  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.31 
 
 
348 aa  63.5  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0160  glycosyl transferase family 9  26.51 
 
 
345 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.081148  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 
402 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4370  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  28.2 
 
 
355 aa  63.5  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1231  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.76 
 
 
356 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 
475 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  26.37 
 
 
361 aa  63.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0069  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  26.56 
 
 
354 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270694  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0849  glycosyl transferase family 9  39.42 
 
 
348 aa  63.2  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0145  glycosyl transferase family 9  27.43 
 
 
334 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0787699  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4147  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  26.56 
 
 
354 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.84 
 
 
352 aa  63.2  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.64 
 
 
357 aa  63.2  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2341  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
390 aa  63.2  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>