More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1978 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0576  heptosyltransferase  86.57 
 
 
418 aa  706    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1967  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  86.57 
 
 
418 aa  706    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0669  heptosyltransferase  86.07 
 
 
418 aa  701    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.822838  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1978  lipopolysaccharide heptosyltransferase II rfaC2  100 
 
 
402 aa  816    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  25.98 
 
 
360 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 
364 aa  98.6  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.15 
 
 
360 aa  98.6  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.86 
 
 
362 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.58 
 
 
352 aa  97.8  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  26.11 
 
 
330 aa  95.5  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.73 
 
 
343 aa  92.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.59 
 
 
368 aa  92.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.88 
 
 
359 aa  91.3  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.66 
 
 
341 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0491  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.69 
 
 
354 aa  90.9  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.66 
 
 
341 aa  90.9  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  27.44 
 
 
341 aa  90.1  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.14 
 
 
516 aa  89.7  7e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.51 
 
 
343 aa  89.4  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 
361 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.26 
 
 
339 aa  86.7  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  22.92 
 
 
330 aa  82.8  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1067  glycosyl transferase family 9  26.88 
 
 
316 aa  82.8  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000716573  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1231  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.66 
 
 
356 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  22.29 
 
 
348 aa  80.9  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 
409 aa  80.5  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.91 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  24.79 
 
 
779 aa  79.7  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0172  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  27.74 
 
 
350 aa  79  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.063279  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  23.6 
 
 
329 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.86 
 
 
353 aa  79  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0473  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.14 
 
 
356 aa  79  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.189899  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0337  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.14 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.86 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.66 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  24.57 
 
 
367 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0589  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.83 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253987  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0749  glycosyl transferase family protein  33.12 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.481302  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.86 
 
 
359 aa  77  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 
392 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.3 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1535  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.64 
 
 
346 aa  75.5  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.31 
 
 
361 aa  74.7  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1796  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.8 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0153252 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1977  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase, putative  24.01 
 
 
365 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2195  glycosyl transferase family protein  38.4 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.111352  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0009  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.84 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0813  glycosyl transferase family protein  38.74 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278172 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0149  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  36.22 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0205  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.12 
 
 
331 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
402 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4359  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114677  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00459  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  27.15 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 
475 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2729  glycosyl transferase family protein  24.92 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637215  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
392 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
392 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.78 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0545  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.38 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0086605  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1403  putative heptosyltransferase III waaq  23.92 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.308915  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0454  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.86 
 
 
341 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  0.709845 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  24.22 
 
 
379 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0670  ADP-heptoselps heptosyltransferase  24.06 
 
 
365 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.374437  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  24.57 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0291  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.06 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2661  glycosyl transferase family 9  24.16 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141025 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.57 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2419  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.06 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1612  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.48 
 
 
346 aa  72  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0032  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.06 
 
 
376 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0586  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.06 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0577  heptosyltransferase family protein  23.8 
 
 
365 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.902815  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1968  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  23.8 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.78963  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0508  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.24 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.104736  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  23.45 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1515  glycosyl transferase family 9  22.06 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  25.14 
 
 
401 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  25.16 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.5 
 
 
361 aa  69.7  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0832  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.78 
 
 
346 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  23.56 
 
 
344 aa  69.3  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0990  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.78 
 
 
346 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0658  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.5 
 
 
346 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  33.33 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2415  glycosyl transferase family protein  24.33 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000869235  hitchhiker  0.0000149362 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0341  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.53 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.455159  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  21.65 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.22 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.45 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0561  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0069  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.4 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270694  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4147  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.4 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0063  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.08 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.877737  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  26.09 
 
 
363 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0578  glycosyl transferase family protein  38.32 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0366  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.8 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0369  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.53 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.489126 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.71 
 
 
367 aa  67  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0682  hypothetical protein  24.75 
 
 
319 aa  67  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0789  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.86 
 
 
335 aa  67  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>