More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5589 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5589  glycosyl transferase family 9  100 
 
 		 334 aa  696    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5041  glycosyl transferase family 9  53.92 
 
 		 326 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.330457  normal  0.05523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3111  glycosyl transferase family 9  46.15 
 
 		 356 aa  288  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0738  putative LPS biosynthesis related glycosyltransferase  45.77 
 
 		 347 aa  252  6e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  43.79 
 
 		 340 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  41.97 
 
 		 379 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1783  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 335 aa  239  4e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  44.04 
 
 		 358 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  45.7 
 
 		 358 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  44.41 
 
 		 358 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2273  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  42.62 
 
 		 371 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0964194  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1009  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  42.62 
 
 		 371 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1297  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  42.62 
 
 		 371 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161852  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3038  putative heptosyltransferase  41.64 
 
 		 371 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1385  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  41.64 
 
 		 371 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3167  putative heptosyltransferase  41.64 
 
 		 371 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  42.43 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6040  glycosyl transferase family protein  44.37 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.511032  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  43 
 
 		 381 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  43 
 
 		 381 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1381  glycosyl transferase family protein  43.71 
 
 		 362 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6448  glycosyl transferase family protein  43.71 
 
 		 362 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  40.69 
 
 		 352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1986  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  40.61 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5534  glycosyl transferase family protein  38.51 
 
 		 369 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.11539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4392  glycosyl transferase family protein  36.75 
 
 		 359 aa  185  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.747454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  35.05 
 
 		 362 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  35.46 
 
 		 368 aa  139  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1781  glycosyl transferase family protein  32.51 
 
 		 380 aa  130  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3977  glycosyl transferase family protein  33.11 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1752  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1766  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 		 318 aa  115  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  29.8 
 
 		 334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  27.62 
 
 		 381 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5532  glycosyl transferase family protein  33.1 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223974 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.38 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.53 
 
 		 362 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0737  glycosyl transferase ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  32.29 
 
 		 370 aa  97.1  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.699457  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  31.08 
 
 		 330 aa  97.1  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0359  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 		 402 aa  96.7  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3562  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 		 400 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  26.05 
 
 		 367 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  25.91 
 
 		 348 aa  93.6  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.9 
 
 		 382 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  24.13 
 
 		 356 aa  90.5  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  23.81 
 
 		 373 aa  90.5  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3628  glycosyl transferase family 9  26.89 
 
 		 362 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0462  glycosyl transferase family 9  29.97 
 
 		 311 aa  89.4  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6399  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 		 400 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.0454867 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.82 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1900  glycosyl transferase family 9  31.16 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1567  glycosyl transferase family 9  28.32 
 
 		 358 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.029243 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0710  glycosyl transferase family protein  28.48 
 
 		 339 aa  87.4  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0566635  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  28.57 
 
 		 361 aa  87.4  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  24.61 
 
 		 401 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  24.61 
 
 		 401 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3702  glycosyl transferase family 9  26.32 
 
 		 408 aa  85.9  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.5 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.12 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0351  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  23.78 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.48 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.4 
 
 		 361 aa  83.6  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2461  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  38.02 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.9 
 
 		 339 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.08 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  25.08 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  23.4 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.84 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.91 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  23.72 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  23.72 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  23.72 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  23.72 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.93 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.26 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  23.53 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1791  glycosyl transferase family protein  24.75 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306314  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  24.66 
 
 		 364 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.4 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3715  hypothetical protein  28.49 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0578  glycosyl transferase family protein  22.87 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.72 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11210  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  27.86 
 
 		 358 aa  75.9  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.957009  normal  0.0981692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3108  glycosyl transferase family 9  28.62 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  25.61 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0585  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5206  glycosyl transferase family 9  27.27 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  24.26 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  23.91 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3025  heptosyltransferase family protein  24.05 
 
 		 517 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  21.36 
 
 		 367 aa  72.8  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  26.03 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1707  glycosyl transferase family 9  25.88 
 
 		 322 aa  72.4  0.000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>