More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6448 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6040  glycosyl transferase family protein  96.69 
 
 
362 aa  681    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.511032  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1381  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
362 aa  728    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6448  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
362 aa  728    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776899  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  89.3 
 
 
358 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  89.01 
 
 
358 aa  623  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  83.99 
 
 
358 aa  610  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1385  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  71.92 
 
 
371 aa  474  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3038  putative heptosyltransferase  71.92 
 
 
371 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3167  putative heptosyltransferase  71.92 
 
 
371 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1297  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  71.63 
 
 
371 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161852  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2273  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  71.63 
 
 
371 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0964194  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1009  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  71.35 
 
 
371 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1986  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  70.71 
 
 
338 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  54.2 
 
 
379 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  58.05 
 
 
390 aa  348  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  51.6 
 
 
381 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  51.6 
 
 
381 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5041  glycosyl transferase family 9  45.7 
 
 
326 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.330457  normal  0.05523 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  46.08 
 
 
340 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3111  glycosyl transferase family 9  44.63 
 
 
356 aa  246  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5589  glycosyl transferase family 9  43.71 
 
 
334 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0738  putative LPS biosynthesis related glycosyltransferase  47.88 
 
 
347 aa  236  7e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5534  glycosyl transferase family protein  46.58 
 
 
369 aa  209  8e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.11539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4392  glycosyl transferase family protein  43.48 
 
 
359 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.747454  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  39.54 
 
 
352 aa  206  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1783  glycosyl transferase family protein  39.81 
 
 
335 aa  203  5e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  37.64 
 
 
362 aa  169  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  36.25 
 
 
368 aa  152  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3977  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 
376 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67849  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  32.82 
 
 
381 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1781  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1752  glycosyl transferase family protein  34.25 
 
 
317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1766  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 
318 aa  122  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791628  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.77 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  34.52 
 
 
334 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0737  glycosyl transferase ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  34.55 
 
 
370 aa  120  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.699457  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 
379 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
400 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0359  glycosyl transferase family protein  31.95 
 
 
402 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  30.61 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  29.83 
 
 
361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.22 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  31.18 
 
 
393 aa  110  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.28 
 
 
368 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  39.53 
 
 
405 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1567  glycosyl transferase family 9  32.9 
 
 
358 aa  105  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.029243 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  29.91 
 
 
367 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
382 aa  103  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  35.33 
 
 
330 aa  103  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.73 
 
 
343 aa  102  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.17 
 
 
359 aa  103  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  39.09 
 
 
401 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  39.09 
 
 
401 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  30.75 
 
 
356 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  27.12 
 
 
349 aa  99.8  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11210  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  36.31 
 
 
358 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.957009  normal  0.0981692 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.5 
 
 
359 aa  99  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.91 
 
 
382 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  23.7 
 
 
330 aa  98.2  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  27.2 
 
 
349 aa  98.6  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.83 
 
 
415 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 
401 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5532  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 
359 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.223974 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  25.84 
 
 
354 aa  97.4  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0353  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
357 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  38.32 
 
 
400 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 
344 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
364 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0690  glycosyl transferase family 9  43.67 
 
 
511 aa  92.8  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.379313  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  29.29 
 
 
371 aa  92  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  34.78 
 
 
367 aa  91.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2461  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  50.89 
 
 
410 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0462  glycosyl transferase family 9  33.44 
 
 
311 aa  92  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 
361 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6399  glycosyl transferase family protein  41.57 
 
 
400 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.0454867 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0320  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  37.97 
 
 
356 aa  90.1  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1900  glycosyl transferase family 9  31.53 
 
 
324 aa  89.7  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3108  glycosyl transferase family 9  31.44 
 
 
358 aa  89.4  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  38.06 
 
 
337 aa  89  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0351  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 
328 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0312  glycosyl transferase family 9  37.74 
 
 
574 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0457  glycosyl transferase family 9  30.61 
 
 
341 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.68138  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5206  glycosyl transferase family 9  35.61 
 
 
401 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0149  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  35.32 
 
 
341 aa  88.2  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  28.36 
 
 
357 aa  87.4  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  30.52 
 
 
361 aa  87  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1571  glycosyl transferase family 9  29.48 
 
 
338 aa  86.3  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  35.29 
 
 
343 aa  86.3  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3562  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 
326 aa  86.3  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  20.45 
 
 
330 aa  86.3  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3478  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.1 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3025  heptosyltransferase family protein  27.2 
 
 
517 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.41 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
403 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0710  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0566635  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.79 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  25.8 
 
 
360 aa  84  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.65 
 
 
352 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3170  heptosyltransferase family protein  39.31 
 
 
622 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>