278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5206 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5206  glycosyl transferase family 9  100 
 
 
401 aa  811    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1654  glycosyl transferase family 9  28.81 
 
 
383 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 
358 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  23.45 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  35.61 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6040  glycosyl transferase family protein  35.61 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.511032  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1381  glycosyl transferase family protein  35.61 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6448  glycosyl transferase family protein  35.61 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776899  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  24.08 
 
 
367 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1385  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.61 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3038  putative heptosyltransferase  28.61 
 
 
371 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3167  putative heptosyltransferase  28.61 
 
 
371 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1986  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  31.79 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5589  glycosyl transferase family 9  27.27 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  34.11 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  34.78 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  34.78 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2273  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  31.79 
 
 
371 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0964194  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1297  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  31.79 
 
 
371 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161852  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1009  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  36.44 
 
 
371 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1791  glycosyl transferase family protein  25.57 
 
 
408 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306314  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  33.61 
 
 
361 aa  70.5  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  24.92 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3025  heptosyltransferase family protein  27.89 
 
 
517 aa  67  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  27.12 
 
 
349 aa  67  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5534  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.11539 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3715  hypothetical protein  32.54 
 
 
382 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  36.13 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  33.33 
 
 
334 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  30.81 
 
 
362 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  26.78 
 
 
349 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3149  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 
366 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  32.61 
 
 
343 aa  65.1  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  34.65 
 
 
352 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3647  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.17 
 
 
397 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3516  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.17 
 
 
387 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0852  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.17 
 
 
387 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2461  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  33.62 
 
 
410 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.86 
 
 
348 aa  63.9  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5041  glycosyl transferase family 9  29.85 
 
 
326 aa  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.330457  normal  0.05523 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  31.88 
 
 
356 aa  63.9  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  31.88 
 
 
373 aa  63.9  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0813  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 
318 aa  63.2  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278172 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.45 
 
 
346 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  24.76 
 
 
361 aa  63.2  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  28.07 
 
 
392 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.66 
 
 
360 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4830  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 
363 aa  62  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.244067  hitchhiker  0.0000484932 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  26.06 
 
 
401 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  23.12 
 
 
341 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  24.31 
 
 
379 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1808  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.8 
 
 
327 aa  61.2  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.12 
 
 
341 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3111  glycosyl transferase family 9  32.2 
 
 
356 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4336  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
347 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0567  glycosyl transferase family 9  24.2 
 
 
362 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0990  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.72 
 
 
346 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0832  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.72 
 
 
346 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
369 aa  60.5  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0690  glycosyl transferase family 9  36.27 
 
 
511 aa  60.1  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.379313  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  30.37 
 
 
347 aa  59.7  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  26.06 
 
 
405 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 
354 aa  59.7  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  30.65 
 
 
356 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  28 
 
 
347 aa  58.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0578  glycosyl transferase family protein  26.26 
 
 
302 aa  59.3  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0454  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.44 
 
 
341 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  0.709845 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1300  heptosyltransferase family protein  33.98 
 
 
625 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0291  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  21.45 
 
 
346 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1989  heptosyltransferase family protein  33.98 
 
 
625 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3170  heptosyltransferase family protein  33.98 
 
 
622 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1388  heptosyltransferase family protein  33.98 
 
 
643 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356236  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  29.2 
 
 
335 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0586  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  21.45 
 
 
346 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
347 aa  58.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2276  heptosyltransferase family protein  33.98 
 
 
622 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 
401 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.67 
 
 
353 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0032  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  21.45 
 
 
376 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3041  heptosyltransferase family protein  33.98 
 
 
622 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3934  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
343 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157476  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 
401 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2419  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  21.45 
 
 
346 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1012  heptosyltransferase family protein  33.98 
 
 
628 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0658  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25 
 
 
346 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  30.41 
 
 
334 aa  58.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.2 
 
 
356 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
359 aa  57.4  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.2 
 
 
356 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.2 
 
 
356 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3108  glycosyl transferase family 9  27.42 
 
 
358 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.2 
 
 
356 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.2 
 
 
356 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.9 
 
 
343 aa  57  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.15 
 
 
350 aa  57.4  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
347 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1047  heptosyltransferase family protein  31.73 
 
 
359 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0821  heptosyltransferase family protein  31.73 
 
 
359 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>