More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0894 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  100 
 
 		 334 aa  655    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1567  glycosyl transferase family 9  56.47 
 
 		 358 aa  298  6e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.029243 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  54.39 
 
 		 330 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1766  glycosyl transferase family protein  47.23 
 
 		 318 aa  246  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1752  glycosyl transferase family protein  47.06 
 
 		 317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0710  glycosyl transferase family protein  51.54 
 
 		 339 aa  239  5.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0566635  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11210  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  49.54 
 
 		 358 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.957009  normal  0.0981692 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1900  glycosyl transferase family 9  43.26 
 
 		 324 aa  206  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0462  glycosyl transferase family 9  48.44 
 
 		 311 aa  202  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0351  glycosyl transferase family protein  47.64 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2461  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  54.49 
 
 		 410 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1385  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  36.28 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2273  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  36.28 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0964194  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3167  putative heptosyltransferase  36.28 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1297  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  36.28 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161852  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3038  putative heptosyltransferase  36.28 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1009  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  36.28 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  33.24 
 
 		 358 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  32.23 
 
 		 340 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3111  glycosyl transferase family 9  31.29 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1986  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  35.79 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5589  glycosyl transferase family 9  30.32 
 
 		 334 aa  113  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 		 379 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  32.19 
 
 		 358 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5534  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 		 369 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.11539 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  33.43 
 
 		 358 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1783  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  32.2 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  27.94 
 
 		 352 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6040  glycosyl transferase family protein  35.64 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.511032  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1381  glycosyl transferase family protein  34.52 
 
 		 362 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6448  glycosyl transferase family protein  34.52 
 
 		 362 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0738  putative LPS biosynthesis related glycosyltransferase  32.62 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 		 361 aa  99.8  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 		 368 aa  99.4  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  43.04 
 
 		 344 aa  99.4  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 		 390 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3977  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 		 376 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  32.48 
 
 		 362 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5041  glycosyl transferase family 9  27.42 
 
 		 326 aa  96.7  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.330457  normal  0.05523 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 		 382 aa  96.3  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0353  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 		 357 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  32.8 
 
 		 381 aa  92.8  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  32.8 
 
 		 381 aa  92.8  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  38.46 
 
 		 334 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  30.46 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  28.53 
 
 		 361 aa  89.7  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  35.33 
 
 		 359 aa  89.4  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  42.14 
 
 		 343 aa  89.4  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0567  glycosyl transferase family 9  39.88 
 
 		 362 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  38.1 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0330  heptosyltransferase family protein  41.86 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.638826  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1910  heptosyltransferase family protein  41.86 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1200  heptosyltransferase  41.86 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1360  heptosyltransferase family protein  41.86 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1047  heptosyltransferase family protein  41.86 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  36.05 
 
 		 361 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0821  heptosyltransferase family protein  41.86 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1209  heptosyltransferase  41.86 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.66 
 
 		 348 aa  87.4  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.16 
 
 		 357 aa  87.8  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  29.7 
 
 		 357 aa  86.3  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1781  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 		 380 aa  85.9  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0987  heptosyltransferase family protein  42.74 
 
 		 358 aa  85.9  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  26.28 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  39.82 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  33.54 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  33.54 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  39.82 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3149  glycosyl transferase family protein  24.16 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  40.71 
 
 		 458 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  39.82 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  39.82 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  39.82 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  26.06 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  39.82 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  38.46 
 
 		 516 aa  84  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.28 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4830  glycosyl transferase family protein  25.38 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.244067  hitchhiker  0.0000484932 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1571  glycosyl transferase family 9  29.71 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0116  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  37.04 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  38.71 
 
 		 354 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  33.49 
 
 		 363 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  38.94 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3715  hypothetical protein  32.52 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4047  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  32.86 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000910947  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  23.08 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  36.53 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  25.24 
 
 		 779 aa  81.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1707  glycosyl transferase family 9  35.67 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4100  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240394 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4123  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  32.86 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0437858  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  33.8 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0089  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  32.86 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000834595  normal  0.156713 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3957  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  32.86 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000313085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3831  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  32.86 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000276456  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  43.31 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>