More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0737 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0737  glycosyl transferase ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  100 
 
 		 370 aa  717    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.699457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5532  glycosyl transferase family protein  50.7 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  45.96 
 
 		 368 aa  250  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3977  glycosyl transferase family protein  47.35 
 
 		 376 aa  247  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  43.42 
 
 		 381 aa  245  9e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0359  glycosyl transferase family protein  42.67 
 
 		 402 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1781  glycosyl transferase family protein  40.76 
 
 		 380 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 		 379 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  36.8 
 
 		 358 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  36.44 
 
 		 358 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  37.36 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  35.67 
 
 		 358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5041  glycosyl transferase family 9  31.6 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.330457  normal  0.05523 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0738  putative LPS biosynthesis related glycosyltransferase  34.97 
 
 		 347 aa  126  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  35.91 
 
 		 381 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  35.91 
 
 		 381 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3038  putative heptosyltransferase  35.99 
 
 		 371 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3167  putative heptosyltransferase  35.99 
 
 		 371 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1381  glycosyl transferase family protein  35.2 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6448  glycosyl transferase family protein  35.2 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1385  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  35.71 
 
 		 371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1297  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  35.71 
 
 		 371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161852  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2273  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  35.71 
 
 		 371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0964194  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  30.65 
 
 		 352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6040  glycosyl transferase family protein  35.2 
 
 		 362 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.511032  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1009  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  35.44 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5534  glycosyl transferase family protein  35.96 
 
 		 369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.11539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3111  glycosyl transferase family 9  32.8 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1783  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 		 335 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5589  glycosyl transferase family 9  32.29 
 
 		 334 aa  113  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4392  glycosyl transferase family protein  35.39 
 
 		 359 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.747454  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1986  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  35.07 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  31.41 
 
 		 340 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  38.59 
 
 		 362 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  29.45 
 
 		 348 aa  94  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.22 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.12 
 
 		 382 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  33.44 
 
 		 401 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 406 aa  87  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 		 361 aa  86.3  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.34 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.41 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  23.66 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0849  glycosyl transferase family 9  36.6 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  28.76 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  30.42 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  26.4 
 
 		 334 aa  79  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.33 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.54 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.54 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  29.71 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.94 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  31.41 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1791  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306314  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1293  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1358  saccharide biosynthesis regulatory protein  34.62 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3934  glycosyl transferase family protein  27.22 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157476  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02452  heptosyl transferase, glycosyltransferase family 9 protein  40.44 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.54 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1707  glycosyl transferase family 9  41.03 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  23.91 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  29.84 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.62 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6399  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 		 400 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.0454867 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  25.62 
 
 		 367 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  30.91 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  29.76 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  25.34 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  29.76 
 
 		 351 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1567  glycosyl transferase family 9  39.6 
 
 		 358 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.029243 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  45.19 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0351  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1601  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  35.52 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.46 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  25.43 
 
 		 779 aa  70.1  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.9 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  21.99 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.75 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5042  glycosyl transferase family 9  25.23 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502044  normal  0.0534111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  27.99 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  38.26 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1613  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.7 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.938574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2260  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  26.76 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1688  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3478  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.03 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  35.54 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0070  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0109  glycosyl transferase family protein  35.54 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1752  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  normal  0.027192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>