More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1567 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1567  glycosyl transferase family 9  100 
 
 
358 aa  685    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.029243 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  56.33 
 
 
334 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  54.4 
 
 
330 aa  241  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0710  glycosyl transferase family protein  52.29 
 
 
339 aa  230  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0566635  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11210  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  49.24 
 
 
358 aa  223  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.957009  normal  0.0981692 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1752  glycosyl transferase family protein  46.25 
 
 
317 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1766  glycosyl transferase family protein  45.28 
 
 
318 aa  213  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791628  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0351  glycosyl transferase family protein  48.37 
 
 
328 aa  199  9e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0462  glycosyl transferase family 9  48.56 
 
 
311 aa  196  8.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1900  glycosyl transferase family 9  42.94 
 
 
324 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2461  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  60.39 
 
 
410 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1385  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  36.29 
 
 
371 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1297  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  36.57 
 
 
371 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161852  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2273  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  36.57 
 
 
371 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0964194  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1009  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  36.63 
 
 
371 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3038  putative heptosyltransferase  36.57 
 
 
371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3167  putative heptosyltransferase  36.57 
 
 
371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  36.82 
 
 
358 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  34.77 
 
 
358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3111  glycosyl transferase family 9  31.09 
 
 
356 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  34.89 
 
 
358 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  33.11 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  35.74 
 
 
379 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1783  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 
335 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1986  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  35.76 
 
 
338 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0738  putative LPS biosynthesis related glycosyltransferase  32.5 
 
 
347 aa  105  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 
390 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  34.28 
 
 
382 aa  102  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5534  glycosyl transferase family protein  35.69 
 
 
369 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.11539 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1381  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
362 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6448  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
362 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776899  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6040  glycosyl transferase family protein  33.44 
 
 
362 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.511032  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  30.09 
 
 
352 aa  99.8  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5589  glycosyl transferase family 9  29.25 
 
 
334 aa  96.3  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5041  glycosyl transferase family 9  29.87 
 
 
326 aa  95.9  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.330457  normal  0.05523 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  34.97 
 
 
381 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  34.97 
 
 
381 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  35.87 
 
 
381 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0353  glycosyl transferase family protein  40.49 
 
 
357 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  33.99 
 
 
362 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  50.96 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 
368 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  28.43 
 
 
348 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0567  glycosyl transferase family 9  37.16 
 
 
362 aa  83.2  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.41 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3977  glycosyl transferase family protein  33.11 
 
 
376 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67849  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0907  glycosyl transferase family 9  28.88 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1571  glycosyl transferase family 9  46.9 
 
 
338 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  41.14 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  34.91 
 
 
360 aa  77.8  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3715  hypothetical protein  29.13 
 
 
382 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
369 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1707  glycosyl transferase family 9  37.2 
 
 
322 aa  77.8  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.3 
 
 
516 aa  75.5  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0330  heptosyltransferase family protein  38.52 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.638826  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1200  heptosyltransferase  38.52 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1910  heptosyltransferase family protein  38.52 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  34.07 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1209  heptosyltransferase  38.52 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1360  heptosyltransferase family protein  38.52 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3562  glycosyl transferase family protein  45.22 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0821  heptosyltransferase family protein  38.52 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1047  heptosyltransferase family protein  38.52 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3702  glycosyl transferase family 9  44.35 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  41.43 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 
406 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0359  glycosyl transferase family protein  39.84 
 
 
402 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  28.48 
 
 
361 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  28.39 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  25.75 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  43.93 
 
 
415 aa  72.8  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  33.75 
 
 
364 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0582  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.59 
 
 
325 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000000638797  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  46.73 
 
 
401 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  46.73 
 
 
401 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  24.69 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  35.76 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3628  glycosyl transferase family 9  44.35 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.85 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  40.52 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0585  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 
406 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  40.52 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  40.52 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  24.05 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  37.84 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0987  heptosyltransferase family protein  41.18 
 
 
358 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3149  glycosyl transferase family protein  24.74 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  45.79 
 
 
400 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.09 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1746  HAD superfamily hydrolase  43.83 
 
 
593 aa  69.7  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0409111 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1805  glycosyl transferase family 9  36.94 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3170  heptosyltransferase family protein  43.93 
 
 
622 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4336  glycosyl transferase family protein  23.82 
 
 
347 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>