More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1766 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1766  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
318 aa  612  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791628  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1752  glycosyl transferase family protein  79.25 
 
 
317 aa  475  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  47.23 
 
 
334 aa  247  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  56.97 
 
 
330 aa  246  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0462  glycosyl transferase family 9  49.03 
 
 
311 aa  223  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0710  glycosyl transferase family protein  50.61 
 
 
339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0566635  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1900  glycosyl transferase family 9  47.04 
 
 
324 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11210  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  45.76 
 
 
358 aa  200  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.957009  normal  0.0981692 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1567  glycosyl transferase family 9  44.3 
 
 
358 aa  199  7.999999999999999e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.029243 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0351  glycosyl transferase family protein  47.19 
 
 
328 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2461  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  57.14 
 
 
410 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  33.13 
 
 
358 aa  122  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  34.08 
 
 
340 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5589  glycosyl transferase family 9  29.9 
 
 
334 aa  115  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  33.22 
 
 
379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1385  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  30.87 
 
 
371 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3167  putative heptosyltransferase  30.87 
 
 
371 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3111  glycosyl transferase family 9  26.76 
 
 
356 aa  106  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3038  putative heptosyltransferase  30.87 
 
 
371 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 
358 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2273  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  30.87 
 
 
371 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0964194  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1297  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  30.87 
 
 
371 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161852  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1009  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  30.87 
 
 
371 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1381  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 
362 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6448  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 
362 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776899  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  33.56 
 
 
358 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3149  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 
366 aa  103  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6040  glycosyl transferase family protein  34 
 
 
362 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.511032  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0738  putative LPS biosynthesis related glycosyltransferase  33.45 
 
 
347 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  32.01 
 
 
381 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  31.29 
 
 
390 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.66 
 
 
348 aa  94  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
369 aa  93.6  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1986  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.67 
 
 
338 aa  92.4  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  30.54 
 
 
352 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5041  glycosyl transferase family 9  27.93 
 
 
326 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.330457  normal  0.05523 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  29.93 
 
 
361 aa  90.5  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 
368 aa  89.7  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5534  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 
369 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.11539 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  30.57 
 
 
362 aa  86.3  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 
367 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0907  glycosyl transferase family 9  28.52 
 
 
382 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  36.53 
 
 
367 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  31.82 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  31.82 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  38.29 
 
 
400 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  28.57 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.22 
 
 
382 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  28.53 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1783  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  27.99 
 
 
406 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3977  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 
376 aa  79.3  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67849  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1571  glycosyl transferase family 9  36.63 
 
 
338 aa  79.3  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3715  hypothetical protein  25.89 
 
 
382 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6399  glycosyl transferase family protein  38.29 
 
 
400 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.0454867 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  36.65 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.51 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  29.07 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  29.83 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 
401 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  38 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 
401 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4830  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.244067  hitchhiker  0.0000484932 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.38 
 
 
415 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.28 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  37.11 
 
 
405 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.87 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.87 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.48 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  27.65 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  26 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  25.49 
 
 
361 aa  72.8  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.89 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  36.88 
 
 
401 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0353  glycosyl transferase family protein  36.59 
 
 
357 aa  72.8  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  26.74 
 
 
357 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0359  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 
402 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  26.76 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  23.24 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0337  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.94 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.03 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0987  heptosyltransferase family protein  40.78 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  34.94 
 
 
389 aa  70.1  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1047  heptosyltransferase family protein  40.78 
 
 
359 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0330  heptosyltransferase family protein  40.78 
 
 
359 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.638826  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0821  heptosyltransferase family protein  40.78 
 
 
359 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1200  heptosyltransferase  40.78 
 
 
359 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.74 
 
 
362 aa  69.3  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0897  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  32.86 
 
 
467 aa  69.3  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29463  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1910  heptosyltransferase family protein  40.78 
 
 
381 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1360  heptosyltransferase family protein  40.78 
 
 
381 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1209  heptosyltransferase  40.78 
 
 
381 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  37.72 
 
 
390 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  27.3 
 
 
367 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  37.72 
 
 
390 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1791  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 
408 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306314  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  37.72 
 
 
390 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0567  glycosyl transferase family 9  41.96 
 
 
362 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>