More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0897 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0897  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  100 
 
 		 467 aa  908    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29463  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1571  glycosyl transferase family 9  62.28 
 
 		 338 aa  371  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  57.61 
 
 		 343 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0457  glycosyl transferase family 9  57.14 
 
 		 341 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.68138  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11250  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  58.53 
 
 		 360 aa  280  5e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.706344  normal  0.204518 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  52.92 
 
 		 344 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2459  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase, glycosyl transferase, family 9  48.59 
 
 		 398 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262404  normal  0.245391 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0567  glycosyl transferase family 9  50.15 
 
 		 362 aa  247  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1760  HAD superfamily hydrolase  49.54 
 
 		 593 aa  240  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1746  HAD superfamily hydrolase  50.87 
 
 		 593 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0409111 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0353  glycosyl transferase family protein  49.42 
 
 		 357 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  33.82 
 
 		 361 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  34.2 
 
 		 348 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  33.89 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  34.68 
 
 		 401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  34.68 
 
 		 401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  34.5 
 
 		 401 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  33.82 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  34.83 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  32.19 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  31.36 
 
 		 367 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6399  glycosyl transferase family protein  34.54 
 
 		 400 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.0454867 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.16 
 
 		 382 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1791  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 		 408 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306314  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.34 
 
 		 415 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3108  glycosyl transferase family 9  30.4 
 
 		 358 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5595  glycosyl transferase family 9  31.29 
 
 		 356 aa  96.7  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421623  normal  0.389921 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3806  glycosyl transferase family 9  29.63 
 
 		 403 aa  94.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4883  glycosyl transferase family 9  29.63 
 
 		 403 aa  94.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  0.0526108 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.29 
 
 		 348 aa  94.4  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  35.37 
 
 		 779 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.59 
 
 		 352 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5042  glycosyl transferase family 9  27.27 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502044  normal  0.0534111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  32.58 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.97 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  28.01 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1567  glycosyl transferase family 9  35.41 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.029243 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.63 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1766  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.43 
 
 		 516 aa  73.9  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1752  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.93 
 
 		 343 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 		 361 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 		 318 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  37.3 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  36.32 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  34.74 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  37.39 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  34.42 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3170  heptosyltransferase family protein  37.5 
 
 		 622 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1989  heptosyltransferase family protein  37.5 
 
 		 625 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1300  heptosyltransferase family protein  37.5 
 
 		 625 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2276  heptosyltransferase family protein  37.5 
 
 		 622 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1012  heptosyltransferase family protein  37.5 
 
 		 628 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3041  heptosyltransferase family protein  37.5 
 
 		 622 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1388  heptosyltransferase family protein  37.5 
 
 		 643 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356236  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2461  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  43.65 
 
 		 410 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 		 358 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  26.92 
 
 		 344 aa  68.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  22.64 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2622  glycosyl transferase family 9  23.08 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1629  heptosyltransferase family protein  32.37 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  28.21 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  31.47 
 
 		 361 aa  67  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  33.54 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1385  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  32.86 
 
 		 371 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 		 367 aa  66.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.09 
 
 		 359 aa  66.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3038  putative heptosyltransferase  33.01 
 
 		 371 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3167  putative heptosyltransferase  33.01 
 
 		 371 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  23.36 
 
 		 369 aa  66.6  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1986  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  32.52 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  29.41 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  32.97 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2273  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  32.52 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0964194  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1297  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  32.52 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161852  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  32.35 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2827  glycosyl transferase family 9  25 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1707  glycosyl transferase family 9  31.52 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0582  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.35 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000000638797  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1009  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  32.52 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1756  glycosyl transferase family 9  27.41 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0677074  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  37.61 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  29.69 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0907  glycosyl transferase family 9  35.59 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  32.71 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  32.71 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3111  glycosyl transferase family 9  36.15 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0899  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.34 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 		 390 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1796  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.95 
 
 		 314 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0153252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5041  glycosyl transferase family 9  26.64 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.330457  normal  0.05523 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0977  glycosyl transferase family 9  30.39 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.412214  hitchhiker  0.000380468 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0337  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  42.86 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0615  glycosyl transferase family 9  39.25 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  37.72 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>