More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11250 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_11250  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  100 
 
 		 360 aa  682    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.706344  normal  0.204518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  65.9 
 
 		 343 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1571  glycosyl transferase family 9  61.29 
 
 		 338 aa  366  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0457  glycosyl transferase family 9  64.14 
 
 		 341 aa  349  5e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.68138  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  59.09 
 
 		 344 aa  334  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2459  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase, glycosyl transferase, family 9  56.78 
 
 		 398 aa  325  8.000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262404  normal  0.245391 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0567  glycosyl transferase family 9  55.68 
 
 		 362 aa  306  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1760  HAD superfamily hydrolase  55 
 
 		 593 aa  298  9e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0353  glycosyl transferase family protein  55.27 
 
 		 357 aa  294  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0897  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  57.35 
 
 		 467 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29463  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1746  HAD superfamily hydrolase  55.43 
 
 		 593 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0409111 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  38.35 
 
 		 361 aa  192  9e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  34.67 
 
 		 348 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  34.76 
 
 		 405 aa  146  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  32.4 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.5 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  36.16 
 
 		 401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 		 401 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 		 401 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3108  glycosyl transferase family 9  34.67 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6399  glycosyl transferase family protein  34.79 
 
 		 400 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.0454867 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  33.88 
 
 		 393 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  35.14 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3806  glycosyl transferase family 9  31.64 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1791  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 		 408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306314  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4883  glycosyl transferase family 9  31.64 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  0.0526108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5042  glycosyl transferase family 9  29.75 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502044  normal  0.0534111 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1989  heptosyltransferase family protein  41.72 
 
 		 625 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1388  heptosyltransferase family protein  41.72 
 
 		 643 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356236  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1300  heptosyltransferase family protein  41.72 
 
 		 625 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2276  heptosyltransferase family protein  41.72 
 
 		 622 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3041  heptosyltransferase family protein  41.72 
 
 		 622 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1012  heptosyltransferase family protein  41.72 
 
 		 628 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3170  heptosyltransferase family protein  41.72 
 
 		 622 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5595  glycosyl transferase family 9  30.15 
 
 		 356 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421623  normal  0.389921 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  32.57 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 		 379 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  32.95 
 
 		 779 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.14 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  22.25 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  26.63 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  38.35 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  26.63 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.29 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.21 
 
 		 361 aa  79.3  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.52 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6040  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.511032  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  33 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  42.64 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  36 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  37.3 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  34.46 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  31.16 
 
 		 381 aa  75.9  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1381  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0359  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6448  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3167  putative heptosyltransferase  30.62 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  29.04 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3038  putative heptosyltransferase  30.62 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1385  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  30.62 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0111  glycosyl transferase family protein  39.84 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1297  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  30.62 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161852  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2273  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  30.62 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0964194  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  24.33 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  29.04 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0262  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  26.67 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0582  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.56 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000000638797  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0161  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  26.67 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1009  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  30.62 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  37.88 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  34.9 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.5 
 
 		 367 aa  72.8  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.55 
 
 		 352 aa  72.8  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  34.9 
 
 		 390 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2461  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  39.26 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  34.9 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  34.9 
 
 		 390 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.36 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  34.9 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  34.9 
 
 		 390 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1567  glycosyl transferase family 9  46.15 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.029243 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1212  glycosyl transferase family protein  35.09 
 
 		 351 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  34.9 
 
 		 390 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  39.23 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  39.23 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  27.79 
 
 		 364 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  33.56 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1766  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.07 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1707  glycosyl transferase family 9  28.57 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  37.9 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3011  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169965  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0585  heptosyltransferase-like protein  25.16 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000371878  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  34.47 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  34.47 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  37.1 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>