More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0457 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0457  glycosyl transferase family 9  100 
 
 		 341 aa  639    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.68138  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1571  glycosyl transferase family 9  65.27 
 
 		 338 aa  386  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  66.27 
 
 		 343 aa  373  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  63.24 
 
 		 344 aa  360  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0353  glycosyl transferase family protein  61.85 
 
 		 357 aa  339  5e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11250  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  64.14 
 
 		 360 aa  327  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.706344  normal  0.204518 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0567  glycosyl transferase family 9  59.25 
 
 		 362 aa  325  6e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2459  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase, glycosyl transferase, family 9  54.31 
 
 		 398 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262404  normal  0.245391 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1760  HAD superfamily hydrolase  60.24 
 
 		 593 aa  301  9e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1746  HAD superfamily hydrolase  60.9 
 
 		 593 aa  296  5e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0409111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0897  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  57.14 
 
 		 467 aa  290  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29463  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  39.15 
 
 		 401 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  36.31 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  39.61 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  39.61 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  36.87 
 
 		 405 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  37.95 
 
 		 400 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6399  glycosyl transferase family protein  38.72 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.0454867 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  35.43 
 
 		 348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  35.29 
 
 		 393 aa  143  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.95 
 
 		 382 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  32.66 
 
 		 367 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  34.68 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3108  glycosyl transferase family 9  33.82 
 
 		 358 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.84 
 
 		 415 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4883  glycosyl transferase family 9  34.79 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  0.0526108 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3806  glycosyl transferase family 9  34.79 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5595  glycosyl transferase family 9  31.52 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421623  normal  0.389921 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1791  glycosyl transferase family protein  30.03 
 
 		 408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306314  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1989  heptosyltransferase family protein  46.15 
 
 		 625 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1388  heptosyltransferase family protein  46.15 
 
 		 643 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3041  heptosyltransferase family protein  46.15 
 
 		 622 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1300  heptosyltransferase family protein  46.15 
 
 		 625 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2276  heptosyltransferase family protein  46.15 
 
 		 622 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3170  heptosyltransferase family protein  46.15 
 
 		 622 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1012  heptosyltransferase family protein  46.15 
 
 		 628 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  37.74 
 
 		 379 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5042  glycosyl transferase family 9  26.35 
 
 		 372 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502044  normal  0.0534111 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  29.49 
 
 		 367 aa  94.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6040  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 		 362 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.511032  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  41.82 
 
 		 334 aa  94  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 		 358 aa  92.8  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1381  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 		 362 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6448  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 		 362 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1900  glycosyl transferase family 9  44.71 
 
 		 324 aa  92.4  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  40.13 
 
 		 361 aa  91.3  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  30.79 
 
 		 358 aa  90.1  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  32.91 
 
 		 779 aa  89.7  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  46.3 
 
 		 362 aa  89.4  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2461  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  48.12 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  30.79 
 
 		 358 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  34.18 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0615  glycosyl transferase family 9  30.92 
 
 		 388 aa  86.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.97 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1297  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  31.88 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161852  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1009  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  31.88 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2273  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  31.88 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0964194  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3167  putative heptosyltransferase  31.88 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3038  putative heptosyltransferase  31.88 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1385  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  31.88 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  33.63 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  32.87 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  44.67 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  21.14 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1756  glycosyl transferase family 9  29.48 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0677074  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.3 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  36.54 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1986  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  35.92 
 
 		 338 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  40.17 
 
 		 340 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.48 
 
 		 361 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  36.69 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.78 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  34.76 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3111  glycosyl transferase family 9  42.74 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1766  glycosyl transferase family protein  31.74 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1567  glycosyl transferase family 9  49.52 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.029243 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0907  glycosyl transferase family 9  26.27 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1047  heptosyltransferase family protein  39.23 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1200  heptosyltransferase  39.23 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1910  heptosyltransferase family protein  39.23 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1360  heptosyltransferase family protein  39.23 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1209  heptosyltransferase  39.23 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0987  heptosyltransferase family protein  40.54 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3288  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase protein  39.31 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0821  heptosyltransferase family protein  39.23 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0330  heptosyltransferase family protein  39.23 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.638826  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1783  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3562  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1601  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.14 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.29 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.96 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3136  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.12 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  31.52 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  28.57 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1297  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.12 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  31.52 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  32.78 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>