More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2459 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2459  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase, glycosyl transferase, family 9  100 
 
 
398 aa  758    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262404  normal  0.245391 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  61.81 
 
 
343 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  51.15 
 
 
344 aa  312  5.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1571  glycosyl transferase family 9  49.74 
 
 
338 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0567  glycosyl transferase family 9  51.76 
 
 
362 aa  295  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0353  glycosyl transferase family protein  51.51 
 
 
357 aa  280  4e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0897  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  48.59 
 
 
467 aa  258  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29463  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0457  glycosyl transferase family 9  61.97 
 
 
341 aa  243  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.68138  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11250  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  48.59 
 
 
360 aa  232  8.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.706344  normal  0.204518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1760  HAD superfamily hydrolase  56.54 
 
 
593 aa  200  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1746  HAD superfamily hydrolase  55.88 
 
 
593 aa  177  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0409111 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  31.82 
 
 
361 aa  149  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 
405 aa  144  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  29.82 
 
 
348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 
401 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.65 
 
 
382 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 
401 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 
401 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
400 aa  123  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  31.07 
 
 
400 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6399  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.0454867 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1791  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 
408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306314  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  30.73 
 
 
393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  27.27 
 
 
367 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.46 
 
 
415 aa  106  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3108  glycosyl transferase family 9  29.14 
 
 
358 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4883  glycosyl transferase family 9  29.61 
 
 
403 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  0.0526108 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3806  glycosyl transferase family 9  29.61 
 
 
403 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5042  glycosyl transferase family 9  25.28 
 
 
372 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502044  normal  0.0534111 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3041  heptosyltransferase family protein  32.65 
 
 
622 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1989  heptosyltransferase family protein  32.65 
 
 
625 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1012  heptosyltransferase family protein  32.65 
 
 
628 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3170  heptosyltransferase family protein  32.65 
 
 
622 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1388  heptosyltransferase family protein  32.65 
 
 
643 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356236  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2276  heptosyltransferase family protein  32.65 
 
 
622 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1300  heptosyltransferase family protein  32.65 
 
 
625 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
358 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5595  glycosyl transferase family 9  31.17 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421623  normal  0.389921 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  34.17 
 
 
779 aa  71.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  29.3 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  31.58 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2461  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  33.9 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  34.38 
 
 
348 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
361 aa  67  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0615  glycosyl transferase family 9  29.83 
 
 
388 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.56 
 
 
352 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1900  glycosyl transferase family 9  32.56 
 
 
324 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3715  hypothetical protein  22.42 
 
 
382 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  24.56 
 
 
340 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.56 
 
 
352 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.56 
 
 
352 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.56 
 
 
340 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.56 
 
 
352 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.56 
 
 
340 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.88 
 
 
339 aa  63.5  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.56 
 
 
352 aa  63.5  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1381  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 
362 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6448  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 
362 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776899  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6040  glycosyl transferase family protein  26.65 
 
 
362 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.511032  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  30.9 
 
 
336 aa  62.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1567  glycosyl transferase family 9  31.84 
 
 
358 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.029243 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  36.27 
 
 
352 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 
382 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  22.69 
 
 
360 aa  61.6  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29 
 
 
299 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  27.93 
 
 
344 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  30 
 
 
350 aa  61.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0907  glycosyl transferase family 9  28.14 
 
 
382 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  30.92 
 
 
381 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0582  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.88 
 
 
325 aa  60.1  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000000638797  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0479  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.19 
 
 
317 aa  60.1  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.89 
 
 
356 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  18.43 
 
 
330 aa  59.3  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1629  heptosyltransferase family protein  33.33 
 
 
341 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34 
 
 
359 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1212  glycosyl transferase family protein  39.42 
 
 
351 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1047  heptosyltransferase family protein  29.68 
 
 
359 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II- LPS biosynthesis, waaF  25 
 
 
349 aa  58.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57864  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1910  heptosyltransferase family protein  29.68 
 
 
381 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1360  heptosyltransferase family protein  29.68 
 
 
381 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1200  heptosyltransferase  29.68 
 
 
359 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1209  heptosyltransferase  29.68 
 
 
381 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0821  heptosyltransferase family protein  29.68 
 
 
359 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2792  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.84 
 
 
362 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0445733  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1707  glycosyl transferase family 9  28.57 
 
 
322 aa  58.5  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0330  heptosyltransferase family protein  29.68 
 
 
359 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.638826  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  37.62 
 
 
352 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  42.67 
 
 
354 aa  58.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  26.79 
 
 
340 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1756  glycosyl transferase family 9  26.5 
 
 
386 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0677074  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25 
 
 
367 aa  57.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  30.19 
 
 
356 aa  57  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.01 
 
 
356 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.01 
 
 
356 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.79 
 
 
356 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.01 
 
 
356 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.01 
 
 
356 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1783  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
335 aa  56.6  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  36 
 
 
367 aa  56.6  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>