More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3806 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3806  glycosyl transferase family 9  100 
 
 		 403 aa  795    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4883  glycosyl transferase family 9  100 
 
 		 403 aa  795    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  0.0526108 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  56.91 
 
 		 415 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  55.17 
 
 		 401 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  54.01 
 
 		 400 aa  329  6e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  54.64 
 
 		 401 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  54.64 
 
 		 401 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  54.23 
 
 		 405 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  50.27 
 
 		 400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  51.02 
 
 		 393 aa  322  5e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6399  glycosyl transferase family protein  52.23 
 
 		 400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.0454867 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  50.68 
 
 		 382 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5042  glycosyl transferase family 9  43.97 
 
 		 372 aa  266  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502044  normal  0.0534111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3108  glycosyl transferase family 9  48.94 
 
 		 358 aa  262  6.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1791  glycosyl transferase family protein  44.28 
 
 		 408 aa  251  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306314  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5595  glycosyl transferase family 9  41.9 
 
 		 356 aa  232  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421623  normal  0.389921 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  39.02 
 
 		 361 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  35.25 
 
 		 367 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  36 
 
 		 348 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  35.95 
 
 		 344 aa  171  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1989  heptosyltransferase family protein  63.19 
 
 		 625 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2276  heptosyltransferase family protein  63.19 
 
 		 622 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1012  heptosyltransferase family protein  63.19 
 
 		 628 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1300  heptosyltransferase family protein  63.19 
 
 		 625 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1388  heptosyltransferase family protein  63.19 
 
 		 643 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3041  heptosyltransferase family protein  63.19 
 
 		 622 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3170  heptosyltransferase family protein  63.19 
 
 		 622 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1571  glycosyl transferase family 9  36.19 
 
 		 338 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  34.05 
 
 		 343 aa  131  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.78 
 
 		 359 aa  127  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.62 
 
 		 343 aa  117  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1760  HAD superfamily hydrolase  33.7 
 
 		 593 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0353  glycosyl transferase family protein  33.79 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.13 
 
 		 359 aa  112  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.76 
 
 		 352 aa  112  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.23 
 
 		 341 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  27.97 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  29.65 
 
 		 356 aa  106  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  28.49 
 
 		 382 aa  106  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.76 
 
 		 346 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0457  glycosyl transferase family 9  34.79 
 
 		 341 aa  106  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.68138  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1746  HAD superfamily hydrolase  34.4 
 
 		 593 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0409111 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0454  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.27 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  0.709845 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.02 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  26.58 
 
 		 779 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.8 
 
 		 352 aa  103  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.99 
 
 		 368 aa  102  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0567  glycosyl transferase family 9  30.79 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.49 
 
 		 337 aa  101  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 		 379 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0990  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.03 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0832  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.03 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0658  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.49 
 
 		 346 aa  100  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  28.57 
 
 		 361 aa  100  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2419  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.5 
 
 		 346 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0291  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.5 
 
 		 346 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0586  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.5 
 
 		 346 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0032  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.5 
 
 		 376 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0626  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 		 340 aa  98.2  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0429094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3770  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.38 
 
 		 351 aa  97.8  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.242011  normal  0.536434 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.23 
 
 		 348 aa  97.1  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  36.62 
 
 		 390 aa  96.3  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2553  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.07 
 
 		 345 aa  96.3  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0582  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.04 
 
 		 325 aa  95.5  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000000638797  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  35.78 
 
 		 381 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0665  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.07 
 
 		 345 aa  95.5  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1237  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.97 
 
 		 314 aa  94.7  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  24.09 
 
 		 360 aa  94.4  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0320  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.09 
 
 		 356 aa  93.6  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0334  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.78 
 
 		 343 aa  93.6  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2022  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.02 
 
 		 345 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2633  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.02 
 
 		 345 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609317  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2792  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.3 
 
 		 362 aa  92.8  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0445733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1805  glycosyl transferase family 9  32.91 
 
 		 308 aa  92.4  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3550  putative adp-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  31.23 
 
 		 342 aa  92.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2459  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase, glycosyl transferase, family 9  29.85 
 
 		 398 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262404  normal  0.245391 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4862  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.18 
 
 		 349 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0366  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.7 
 
 		 349 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.02 
 
 		 361 aa  92  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0341  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.44 
 
 		 349 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.455159  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0149  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.79 
 
 		 341 aa  91.3  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0369  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.44 
 
 		 349 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.489126 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.26 
 
 		 367 aa  90.9  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0465  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.65 
 
 		 344 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  33.16 
 
 		 406 aa  90.5  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11250  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  32.49 
 
 		 360 aa  89.7  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.706344  normal  0.204518 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  33.53 
 
 		 354 aa  89.7  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  23.76 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5003  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.11 
 
 		 344 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0520  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 		 344 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.53 
 
 		 360 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1796  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.07 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0153252 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  35.98 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  35.98 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0491  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.92 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 		 368 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2680  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.48 
 
 		 329 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196159  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.03 
 
 		 367 aa  88.6  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  42.33 
 
 		 334 aa  87.8  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  26.3 
 
 		 341 aa  87  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>