More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5595 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5595  glycosyl transferase family 9  100 
 
 		 356 aa  727    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421623  normal  0.389921 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5042  glycosyl transferase family 9  46.7 
 
 		 372 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502044  normal  0.0534111 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1791  glycosyl transferase family protein  47.19 
 
 		 408 aa  270  4e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306314  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3108  glycosyl transferase family 9  42.94 
 
 		 358 aa  259  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  44.09 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  45.06 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  42.72 
 
 		 405 aa  239  8e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 		 401 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 		 401 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 		 401 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6399  glycosyl transferase family protein  43.93 
 
 		 400 aa  235  8e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.0454867 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  41.69 
 
 		 415 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  42.78 
 
 		 393 aa  220  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  40.38 
 
 		 382 aa  218  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4883  glycosyl transferase family 9  41.28 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  0.0526108 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3806  glycosyl transferase family 9  41.28 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  35.09 
 
 		 361 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  35.43 
 
 		 348 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  33.02 
 
 		 367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  33.15 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3170  heptosyltransferase family protein  47.88 
 
 		 622 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1388  heptosyltransferase family protein  47.88 
 
 		 643 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3041  heptosyltransferase family protein  47.88 
 
 		 622 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1989  heptosyltransferase family protein  47.27 
 
 		 625 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1012  heptosyltransferase family protein  47.27 
 
 		 628 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2276  heptosyltransferase family protein  47.27 
 
 		 622 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1300  heptosyltransferase family protein  47.27 
 
 		 625 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.67 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1571  glycosyl transferase family 9  31.65 
 
 		 338 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  33.11 
 
 		 356 aa  113  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.51 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.72 
 
 		 352 aa  100  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.93 
 
 		 368 aa  100  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0457  glycosyl transferase family 9  31.35 
 
 		 341 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.68138  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.33 
 
 		 343 aa  95.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  31.17 
 
 		 343 aa  95.5  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.67 
 
 		 352 aa  95.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.55 
 
 		 359 aa  92.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  25.07 
 
 		 382 aa  89.4  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1746  HAD superfamily hydrolase  32.38 
 
 		 593 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0409111 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 		 364 aa  87.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30 
 
 		 341 aa  87  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0149  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.52 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3033  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0205  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.38 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  27.39 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.12 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  19.72 
 
 		 516 aa  83.2  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  29.57 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0626  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0429094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1760  HAD superfamily hydrolase  30.94 
 
 		 593 aa  83.2  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0454  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.7 
 
 		 341 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  0.709845 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.64 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 		 403 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  24.35 
 
 		 779 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.46 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5670  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.42 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0897  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  31.08 
 
 		 467 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29463  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  28.14 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5534  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.11539 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  28.48 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0353  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  26.24 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00459  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  22.81 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  23.87 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.93 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.57 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.72 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.79 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0567  glycosyl transferase family 9  28.65 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3025  heptosyltransferase family protein  25.15 
 
 		 517 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  25.97 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.73 
 
 		 343 aa  72  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.24 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.67 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1783  glycosyl transferase family protein  23.59 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0508  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.32 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.104736  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0491  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.59 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3149  glycosyl transferase family protein  24.47 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0337  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  22.81 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2553  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.92 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0658  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.92 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3421  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase-1  23.86 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3715  hypothetical protein  24.82 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0601  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.65 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1612  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.53 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0465  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.06 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0320  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.85 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2680  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.54 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196159  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  23.33 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2633  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.24 
 
 		 345 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609317  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2022  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.24 
 
 		 345 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1060  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.61 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.845943 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  27.12 
 
 		 334 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2616  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.89 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5964  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.38 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.262349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>