More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3288 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3288  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase protein  100 
 
 
375 aa  746    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1257  glycosyl transferase family 9  92 
 
 
375 aa  662    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492606  normal  0.595723 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1209  heptosyltransferase  73.92 
 
 
381 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1910  heptosyltransferase family protein  73.92 
 
 
381 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1360  heptosyltransferase family protein  73.92 
 
 
381 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0987  heptosyltransferase family protein  75.43 
 
 
358 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1200  heptosyltransferase  74.29 
 
 
359 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1047  heptosyltransferase family protein  74 
 
 
359 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0330  heptosyltransferase family protein  74 
 
 
359 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.638826  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0821  heptosyltransferase family protein  74 
 
 
359 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0167  glycosyl transferase family 9  44.24 
 
 
369 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3952  glycosyl transferase family 9  44.8 
 
 
368 aa  295  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2252  heptosyltransferase family protein  26.61 
 
 
370 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.548459  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  31.46 
 
 
381 aa  86.7  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  31.23 
 
 
379 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.08 
 
 
352 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  30.61 
 
 
458 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  29.25 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  29.25 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  29.25 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  29.25 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  29.25 
 
 
394 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  28.52 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  29.25 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1688  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.88 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.16 
 
 
352 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.16 
 
 
352 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0607  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 
386 aa  79.7  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.16 
 
 
352 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.84 
 
 
352 aa  78.2  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.21 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
361 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  39.67 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.24 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  43.36 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  42.48 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0466  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  40.71 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.76 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.89 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.76 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  24.76 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  26.1 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  27.62 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.53 
 
 
343 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  26.81 
 
 
352 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  25.19 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.39 
 
 
392 aa  72  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.34 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.34 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5746  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  32.28 
 
 
355 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.34 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.34 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3111  glycosyl transferase family 9  28.52 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.34 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0682  hypothetical protein  29.68 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  27.24 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44850  lipopolysaccharide heptosyltransferase I, waaC  31.36 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.721697  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.35 
 
 
352 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.381359 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 
475 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2461  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  41.44 
 
 
410 aa  69.7  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1783  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66240  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  32.28 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0367  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  38.6 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0342  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  38.6 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1870  heptosyltransferase family protein  28.85 
 
 
352 aa  69.3  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1248  glycosyl transferase family 9  25 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.9727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0353  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
357 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0738  putative LPS biosynthesis related glycosyltransferase  29.63 
 
 
347 aa  68.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  25.54 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5002  lipopolysaccharide heptosyltransferase  35.96 
 
 
354 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0521  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
354 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2661  glycosyl transferase family 9  26.71 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141025 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.05 
 
 
516 aa  67.4  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0907  glycosyl transferase family 9  29.03 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.18 
 
 
389 aa  67  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.64 
 
 
341 aa  67  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
333 aa  67  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  25.15 
 
 
332 aa  67  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  28.14 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
404 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1781  glycosyl transferase family protein  25.84 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0580  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  37.96 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0447499 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 
347 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  26.13 
 
 
349 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  26.64 
 
 
349 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 
358 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5534  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 
369 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.11539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5589  glycosyl transferase family 9  24.46 
 
 
334 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1611  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  32.59 
 
 
321 aa  65.1  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.3 
 
 
341 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0749  glycosyl transferase family protein  27.22 
 
 
331 aa  64.3  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.481302  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  31.74 
 
 
362 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>