More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0462 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0462  glycosyl transferase family 9  100 
 
 		 311 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1766  glycosyl transferase family protein  49.68 
 
 		 318 aa  246  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1752  glycosyl transferase family protein  50.16 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  51.52 
 
 		 330 aa  223  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  48.44 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0710  glycosyl transferase family protein  54.81 
 
 		 339 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0566635  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1567  glycosyl transferase family 9  49.01 
 
 		 358 aa  202  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.029243 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11210  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  48.78 
 
 		 358 aa  200  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.957009  normal  0.0981692 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1900  glycosyl transferase family 9  46.08 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0351  glycosyl transferase family protein  47.19 
 
 		 328 aa  176  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2461  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  56.96 
 
 		 410 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5589  glycosyl transferase family 9  31.36 
 
 		 334 aa  108  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  33.56 
 
 		 358 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3111  glycosyl transferase family 9  30.39 
 
 		 356 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6040  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 		 362 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.511032  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  29.84 
 
 		 340 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  33.44 
 
 		 358 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5534  glycosyl transferase family protein  34.5 
 
 		 369 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.11539 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 379 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  34.11 
 
 		 358 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3038  putative heptosyltransferase  33.01 
 
 		 371 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1385  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  33.22 
 
 		 371 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1381  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 		 362 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6448  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 		 362 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3167  putative heptosyltransferase  33.01 
 
 		 371 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1783  glycosyl transferase family protein  32.66 
 
 		 335 aa  93.6  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2273  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  32.68 
 
 		 371 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0964194  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1009  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  32.68 
 
 		 371 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1297  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  32.68 
 
 		 371 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161852  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0738  putative LPS biosynthesis related glycosyltransferase  33.11 
 
 		 347 aa  91.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  34.91 
 
 		 362 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  31.23 
 
 		 352 aa  90.5  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  29.45 
 
 		 400 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 		 361 aa  85.9  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3149  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 366 aa  85.9  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  28.06 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1986  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  31.85 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5041  glycosyl transferase family 9  28.28 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.330457  normal  0.05523 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  33.21 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  49.14 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.23 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  35.35 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  35.35 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  45.95 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0567  glycosyl transferase family 9  47.75 
 
 		 362 aa  75.9  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  32.15 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  38.24 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2792  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  43.97 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0445733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0353  glycosyl transferase family protein  45.05 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3628  glycosyl transferase family 9  45.05 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1610  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.21 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.812323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3715  hypothetical protein  24.84 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.04 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3702  glycosyl transferase family 9  45.05 
 
 		 408 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.9 
 
 		 382 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0342  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.15 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0367  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.15 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  33.52 
 
 		 354 aa  72  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3562  glycosyl transferase family protein  44.14 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1612  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  36.28 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  42.72 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3770  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  40.24 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.242011  normal  0.536434 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.74 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.55 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381359 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1571  glycosyl transferase family 9  47.41 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  29.21 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0907  glycosyl transferase family 9  30.3 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  41.32 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  35.03 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4512  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.59 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.935025  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  30.72 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4370  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  32.08 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1164  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.38 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1283  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.38 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0326362  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0111  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 		 359 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 		 400 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  26.91 
 
 		 357 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1209  heptosyltransferase  30.69 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1910  heptosyltransferase family protein  30.69 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001811  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.09 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1360  heptosyltransferase family protein  30.69 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0580  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  22.88 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.604166  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0821  heptosyltransferase family protein  30.69 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4089  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  32.08 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1200  heptosyltransferase  30.69 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4830  glycosyl transferase family protein  26.26 
 
 		 363 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.244067  hitchhiker  0.0000484932 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0334  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.24 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1047  heptosyltransferase family protein  30.69 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0330  heptosyltransferase family protein  30.69 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.638826  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1237  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.42 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  31.58 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  26.22 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.41 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>